Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdcd1Q02242 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdcd1Q02242 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdcd1Q02242 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdcd1Q02242 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pdcd1Q02242 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pdcd1Q02242 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pdcd1Q02242 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdcd1Q02242 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdcd1Q02242 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdcd1Q02242 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdcd1Q02242 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdcd1Q02242 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pdcd1Q02242 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdcd1Q02242 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdcd1Q02242 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdcd1Q02242 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdcd1Q02242 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdcd1Q02242 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdcd1Q02242 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdcd1Q02242 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdcd1Q02242 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdcd1Q02242 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pdcd1Q02242 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Pdcd1Q02242 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Pdcd1Q02242 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdcd1Q02242 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Pdcd1Q02242 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pdcd1Q02242 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pdcd1Q02242 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdcd1Q02242 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdcd1Q02242 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdcd1Q02242 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pdcd1Q02242 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pdcd1Q02242 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdcd1Q02242 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdcd1Q02242 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pdcd1Q02242 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdcd1Q02242 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdcd1Q02242 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdcd1Q02242 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdcd1Q02242 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdcd1Q02242 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdcd1Q02242 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdcd1Q02242 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdcd1Q02242 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdcd1Q02242 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdcd1Q02242 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdcd1Q02242 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdcd1Q02242 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdcd1Q02242 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdcd1Q02242 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdcd1Q02242 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdcd1Q02242 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdcd1Q02242 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdcd1Q02242 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdcd1Q02242 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdcd1Q02242 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdcd1Q02242 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdcd1Q02242 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdcd1Q02242 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdcd1Q02242 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdcd1Q02242 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdcd1Q02242 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdcd1Q02242 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdcd1Q02242 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdcd1Q02242 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdcd1Q02242 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdcd1Q02242 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdcd1Q02242 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdcd1Q02242 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdcd1Q02242 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdcd1Q02242 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pdcd1Q02242 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pdcd1Q02242 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pdcd1Q02242 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pdcd1Q02242 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdcd1Q02242 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdcd1Q02242 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdcd1Q02242 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdcd1Q02242 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pdcd1Q02242 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pdcd1Q02242 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pdcd1Q02242 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdcd1Q02242 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdcd1Q02242 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdcd1Q02242 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdcd1Q02242 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdcd1Q02242 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdcd1Q02242 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdcd1Q02242 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdcd1Q02242 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdcd1Q02242 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdcd1Q02242 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdcd1Q02242 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdcd1Q02242 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdcd1Q02242 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdcd1Q02242 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdcd1Q02242 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdcd1Q02242 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms