Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
EgfrQ01279 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
EgfrQ01279 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
EgfrQ01279 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
EgfrQ01279 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
EgfrQ01279 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
EgfrQ01279 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
EgfrQ01279 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
EgfrQ01279 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
EgfrQ01279 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
EgfrQ01279 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
EgfrQ01279 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
EgfrQ01279 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
EgfrQ01279 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
EgfrQ01279 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
EgfrQ01279 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
EgfrQ01279 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
EgfrQ01279 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
EgfrQ01279 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
EgfrQ01279 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
EgfrQ01279 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
EgfrQ01279 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
EgfrQ01279 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
EgfrQ01279 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
EgfrQ01279 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
EgfrQ01279 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
EgfrQ01279 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
EgfrQ01279 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
EgfrQ01279 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
EgfrQ01279 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
EgfrQ01279 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
EgfrQ01279 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
EgfrQ01279 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
EgfrQ01279 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
EgfrQ01279 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
EgfrQ01279 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
EgfrQ01279 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
EgfrQ01279 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
EgfrQ01279 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
EgfrQ01279 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
EgfrQ01279 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
EgfrQ01279 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
EgfrQ01279 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
EgfrQ01279 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
EgfrQ01279 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
EgfrQ01279 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
EgfrQ01279 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
EgfrQ01279 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
EgfrQ01279 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
EgfrQ01279 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
EgfrQ01279 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
EgfrQ01279 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
EgfrQ01279 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
EgfrQ01279 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
EgfrQ01279 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
EgfrQ01279 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
EgfrQ01279 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
EgfrQ01279 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
EgfrQ01279 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
EgfrQ01279 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
EgfrQ01279 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
EgfrQ01279 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
EgfrQ01279 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
EgfrQ01279 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
EgfrQ01279 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
EgfrQ01279 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
EgfrQ01279 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
EgfrQ01279 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
EgfrQ01279 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
EgfrQ01279 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
EgfrQ01279 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
EgfrQ01279 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
EgfrQ01279 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
EgfrQ01279 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
EgfrQ01279 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
EgfrQ01279 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
EgfrQ01279 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
EgfrQ01279 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
EgfrQ01279 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
EgfrQ01279 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
EgfrQ01279 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
EgfrQ01279 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
EgfrQ01279 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
EgfrQ01279 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
EgfrQ01279 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
EgfrQ01279 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
EgfrQ01279 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
EgfrQ01279 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
EgfrQ01279 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
EgfrQ01279 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
EgfrQ01279 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
EgfrQ01279 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
EgfrQ01279 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
EgfrQ01279 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
EgfrQ01279 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
EgfrQ01279 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
EgfrQ01279 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
EgfrQ01279 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
EgfrQ01279 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
EgfrQ01279 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms