Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pde1bQ01065 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pde1bQ01065 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pde1bQ01065 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pde1bQ01065 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pde1bQ01065 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pde1bQ01065 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pde1bQ01065 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pde1bQ01065 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pde1bQ01065 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pde1bQ01065 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pde1bQ01065 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Pde1bQ01065 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pde1bQ01065 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pde1bQ01065 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pde1bQ01065 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pde1bQ01065 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pde1bQ01065 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pde1bQ01065 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pde1bQ01065 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pde1bQ01065 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pde1bQ01065 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pde1bQ01065 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pde1bQ01065 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Pde1bQ01065 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pde1bQ01065 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pde1bQ01065 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pde1bQ01065 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pde1bQ01065 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pde1bQ01065 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pde1bQ01065 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pde1bQ01065 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pde1bQ01065 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pde1bQ01065 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pde1bQ01065 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pde1bQ01065 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pde1bQ01065 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pde1bQ01065 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pde1bQ01065 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pde1bQ01065 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pde1bQ01065 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pde1bQ01065 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pde1bQ01065 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Pde1bQ01065 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pde1bQ01065 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pde1bQ01065 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pde1bQ01065 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pde1bQ01065 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pde1bQ01065 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pde1bQ01065 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pde1bQ01065 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pde1bQ01065 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pde1bQ01065 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pde1bQ01065 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pde1bQ01065 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pde1bQ01065 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pde1bQ01065 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pde1bQ01065 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pde1bQ01065 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Pde1bQ01065 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pde1bQ01065 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pde1bQ01065 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pde1bQ01065 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pde1bQ01065 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pde1bQ01065 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pde1bQ01065 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pde1bQ01065 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pde1bQ01065 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pde1bQ01065 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pde1bQ01065 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pde1bQ01065 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pde1bQ01065 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pde1bQ01065 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pde1bQ01065 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pde1bQ01065 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pde1bQ01065 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pde1bQ01065 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Pde1bQ01065 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pde1bQ01065 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pde1bQ01065 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pde1bQ01065 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pde1bQ01065 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pde1bQ01065 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pde1bQ01065 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pde1bQ01065 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Pde1bQ01065 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pde1bQ01065 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pde1bQ01065 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pde1bQ01065 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pde1bQ01065 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pde1bQ01065 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pde1bQ01065 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pde1bQ01065 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pde1bQ01065 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pde1bQ01065 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pde1bQ01065 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pde1bQ01065 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pde1bQ01065 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Pde1bQ01065 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pde1bQ01065 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms