Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SeleQ00690 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SeleQ00690 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SeleQ00690 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SeleQ00690 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SeleQ00690 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SeleQ00690 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SeleQ00690 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SeleQ00690 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SeleQ00690 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SeleQ00690 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SeleQ00690 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SeleQ00690 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SeleQ00690 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SeleQ00690 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SeleQ00690 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SeleQ00690 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SeleQ00690 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SeleQ00690 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SeleQ00690 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SeleQ00690 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SeleQ00690 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SeleQ00690 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SeleQ00690 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SeleQ00690 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SeleQ00690 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SeleQ00690 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SeleQ00690 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SeleQ00690 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SeleQ00690 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SeleQ00690 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SeleQ00690 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SeleQ00690 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SeleQ00690 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SeleQ00690 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SeleQ00690 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SeleQ00690 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SeleQ00690 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SeleQ00690 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SeleQ00690 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SeleQ00690 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SeleQ00690 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SeleQ00690 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SeleQ00690 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SeleQ00690 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SeleQ00690 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SeleQ00690 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SeleQ00690 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SeleQ00690 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SeleQ00690 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SeleQ00690 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SeleQ00690 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SeleQ00690 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SeleQ00690 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SeleQ00690 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SeleQ00690 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SeleQ00690 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SeleQ00690 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SeleQ00690 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SeleQ00690 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SeleQ00690 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SeleQ00690 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SeleQ00690 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SeleQ00690 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SeleQ00690 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SeleQ00690 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SeleQ00690 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SeleQ00690 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SeleQ00690 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SeleQ00690 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SeleQ00690 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SeleQ00690 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SeleQ00690 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SeleQ00690 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SeleQ00690 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SeleQ00690 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SeleQ00690 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SeleQ00690 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SeleQ00690 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SeleQ00690 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SeleQ00690 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SeleQ00690 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SeleQ00690 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SeleQ00690 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SeleQ00690 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SeleQ00690 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SeleQ00690 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SeleQ00690 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SeleQ00690 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SeleQ00690 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SeleQ00690 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SeleQ00690 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SeleQ00690 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SeleQ00690 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SeleQ00690 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SeleQ00690 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SeleQ00690 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SeleQ00690 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SeleQ00690 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SeleQ00690 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms