Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Npas1P97459 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Npas1P97459 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Npas1P97459 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Npas1P97459 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Npas1P97459 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Npas1P97459 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Npas1P97459 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Npas1P97459 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Npas1P97459 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Npas1P97459 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Npas1P97459 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Npas1P97459 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Npas1P97459 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Npas1P97459 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Npas1P97459 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Npas1P97459 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Npas1P97459 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Npas1P97459 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Npas1P97459 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Npas1P97459 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Npas1P97459 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Npas1P97459 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Npas1P97459 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Npas1P97459 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Npas1P97459 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Npas1P97459 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Npas1P97459 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Npas1P97459 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Npas1P97459 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Npas1P97459 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Npas1P97459 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Npas1P97459 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Npas1P97459 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Npas1P97459 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Npas1P97459 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Npas1P97459 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Npas1P97459 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Npas1P97459 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Npas1P97459 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Npas1P97459 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Npas1P97459 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Npas1P97459 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Npas1P97459 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Npas1P97459 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Npas1P97459 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Npas1P97459 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Npas1P97459 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Npas1P97459 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Npas1P97459 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Npas1P97459 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Npas1P97459 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Npas1P97459 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Npas1P97459 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Npas1P97459 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Npas1P97459 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Npas1P97459 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Npas1P97459 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Npas1P97459 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Npas1P97459 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Npas1P97459 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Npas1P97459 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Npas1P97459 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Npas1P97459 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Npas1P97459 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Npas1P97459 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Npas1P97459 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Npas1P97459 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Npas1P97459 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Npas1P97459 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Npas1P97459 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Npas1P97459 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Npas1P97459 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Npas1P97459 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npas1P97459 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Npas1P97459 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npas1P97459 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npas1P97459 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npas1P97459 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npas1P97459 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Npas1P97459 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Npas1P97459 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Npas1P97459 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Npas1P97459 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Npas1P97459 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Npas1P97459 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Npas1P97459 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Npas1P97459 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Npas1P97459 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Npas1P97459 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Npas1P97459 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Npas1P97459 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Npas1P97459 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Npas1P97459 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Npas1P97459 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Npas1P97459 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Npas1P97459 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Npas1P97459 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Npas1P97459 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Npas1P97459 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms