Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bop1P97452 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bop1P97452 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bop1P97452 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bop1P97452 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bop1P97452 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bop1P97452 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bop1P97452 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bop1P97452 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bop1P97452 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bop1P97452 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bop1P97452 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bop1P97452 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bop1P97452 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bop1P97452 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bop1P97452 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bop1P97452 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Bop1P97452 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bop1P97452 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bop1P97452 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bop1P97452 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bop1P97452 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bop1P97452 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bop1P97452 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bop1P97452 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bop1P97452 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bop1P97452 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bop1P97452 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bop1P97452 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bop1P97452 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bop1P97452 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Bop1P97452 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bop1P97452 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bop1P97452 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bop1P97452 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bop1P97452 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bop1P97452 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bop1P97452 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bop1P97452 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bop1P97452 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bop1P97452 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bop1P97452 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Bop1P97452 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bop1P97452 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bop1P97452 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bop1P97452 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Bop1P97452 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bop1P97452 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bop1P97452 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bop1P97452 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bop1P97452 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bop1P97452 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bop1P97452 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bop1P97452 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bop1P97452 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bop1P97452 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Bop1P97452 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bop1P97452 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bop1P97452 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bop1P97452 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bop1P97452 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bop1P97452 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bop1P97452 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bop1P97452 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bop1P97452 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bop1P97452 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bop1P97452 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bop1P97452 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bop1P97452 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Bop1P97452 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bop1P97452 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bop1P97452 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bop1P97452 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bop1P97452 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bop1P97452 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Bop1P97452 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bop1P97452 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bop1P97452 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bop1P97452 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bop1P97452 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bop1P97452 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bop1P97452 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Bop1P97452 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bop1P97452 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bop1P97452 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bop1P97452 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bop1P97452 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bop1P97452 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bop1P97452 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bop1P97452 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bop1P97452 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bop1P97452 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bop1P97452 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bop1P97452 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bop1P97452 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bop1P97452 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bop1P97452 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bop1P97452 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bop1P97452 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Bop1P97452 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms