Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Irx1P81068 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Irx1P81068 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Irx1P81068 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irx1P81068 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irx1P81068 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Irx1P81068 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Irx1P81068 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Irx1P81068 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Irx1P81068 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Irx1P81068 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Irx1P81068 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Irx1P81068 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Irx1P81068 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Irx1P81068 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Irx1P81068 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Irx1P81068 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Irx1P81068 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Irx1P81068 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Irx1P81068 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irx1P81068 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irx1P81068 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Irx1P81068 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irx1P81068 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irx1P81068 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Irx1P81068 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Irx1P81068 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Irx1P81068 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Irx1P81068 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Irx1P81068 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Irx1P81068 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Irx1P81068 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Irx1P81068 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Irx1P81068 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Irx1P81068 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Irx1P81068 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Irx1P81068 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Irx1P81068 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Irx1P81068 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Irx1P81068 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Irx1P81068 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Irx1P81068 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Irx1P81068 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Irx1P81068 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Irx1P81068 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Irx1P81068 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Irx1P81068 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irx1P81068 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irx1P81068 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Irx1P81068 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Irx1P81068 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Irx1P81068 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Irx1P81068 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irx1P81068 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Irx1P81068 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irx1P81068 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irx1P81068 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irx1P81068 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Irx1P81068 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irx1P81068 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irx1P81068 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irx1P81068 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Irx1P81068 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx1P81068 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx1P81068 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Irx1P81068 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Irx1P81068 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Irx1P81068 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irx1P81068 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irx1P81068 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irx1P81068 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irx1P81068 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Irx1P81068 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Irx1P81068 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Irx1P81068 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Irx1P81068 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Irx1P81068 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Irx1P81068 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Irx1P81068 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Irx1P81068 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irx1P81068 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irx1P81068 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Irx1P81068 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Irx1P81068 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Irx1P81068 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Irx1P81068 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Irx1P81068 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Irx1P81068 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Irx1P81068 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Irx1P81068 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Irx1P81068 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Irx1P81068 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Irx1P81068 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Irx1P81068 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Irx1P81068 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Irx1P81068 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Irx1P81068 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Irx1P81068 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Irx1P81068 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Irx1P81068 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms