Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp9xP70398 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp9xP70398 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp9xP70398 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp9xP70398 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp9xP70398 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp9xP70398 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp9xP70398 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp9xP70398 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp9xP70398 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp9xP70398 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp9xP70398 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp9xP70398 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp9xP70398 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp9xP70398 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp9xP70398 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp9xP70398 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp9xP70398 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp9xP70398 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp9xP70398 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp9xP70398 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp9xP70398 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp9xP70398 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp9xP70398 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp9xP70398 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp9xP70398 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp9xP70398 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp9xP70398 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp9xP70398 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp9xP70398 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp9xP70398 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp9xP70398 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp9xP70398 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp9xP70398 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp9xP70398 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp9xP70398 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp9xP70398 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp9xP70398 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp9xP70398 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp9xP70398 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp9xP70398 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp9xP70398 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp9xP70398 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp9xP70398 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp9xP70398 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp9xP70398 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp9xP70398 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp9xP70398 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp9xP70398 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp9xP70398 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp9xP70398 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp9xP70398 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp9xP70398 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp9xP70398 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp9xP70398 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp9xP70398 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp9xP70398 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp9xP70398 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp9xP70398 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp9xP70398 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp9xP70398 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp9xP70398 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp9xP70398 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp9xP70398 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp9xP70398 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp9xP70398 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp9xP70398 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp9xP70398 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp9xP70398 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp9xP70398 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp9xP70398 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp9xP70398 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp9xP70398 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp9xP70398 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp9xP70398 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp9xP70398 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp9xP70398 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp9xP70398 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp9xP70398 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp9xP70398 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp9xP70398 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp9xP70398 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp9xP70398 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp9xP70398 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp9xP70398 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp9xP70398 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp9xP70398 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp9xP70398 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp9xP70398 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp9xP70398 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp9xP70398 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp9xP70398 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp9xP70398 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp9xP70398 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp9xP70398 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp9xP70398 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp9xP70398 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp9xP70398 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp9xP70398 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp9xP70398 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
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