Protein–RNA interactions for Protein: P70194

Clec4f, C-type lectin domain family 4 member F, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4fP70194 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Clec4fP70194 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clec4fP70194 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clec4fP70194 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clec4fP70194 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Clec4fP70194 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clec4fP70194 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clec4fP70194 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clec4fP70194 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clec4fP70194 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clec4fP70194 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clec4fP70194 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clec4fP70194 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clec4fP70194 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clec4fP70194 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clec4fP70194 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clec4fP70194 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clec4fP70194 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Clec4fP70194 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clec4fP70194 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clec4fP70194 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clec4fP70194 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Clec4fP70194 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clec4fP70194 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clec4fP70194 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clec4fP70194 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clec4fP70194 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clec4fP70194 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clec4fP70194 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clec4fP70194 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clec4fP70194 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Clec4fP70194 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clec4fP70194 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clec4fP70194 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clec4fP70194 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clec4fP70194 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clec4fP70194 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clec4fP70194 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Clec4fP70194 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clec4fP70194 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clec4fP70194 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clec4fP70194 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clec4fP70194 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Clec4fP70194 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clec4fP70194 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clec4fP70194 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clec4fP70194 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clec4fP70194 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clec4fP70194 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clec4fP70194 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clec4fP70194 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clec4fP70194 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clec4fP70194 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clec4fP70194 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clec4fP70194 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clec4fP70194 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clec4fP70194 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Clec4fP70194 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clec4fP70194 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clec4fP70194 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clec4fP70194 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clec4fP70194 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clec4fP70194 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clec4fP70194 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clec4fP70194 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clec4fP70194 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clec4fP70194 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clec4fP70194 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clec4fP70194 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clec4fP70194 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Clec4fP70194 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clec4fP70194 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clec4fP70194 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clec4fP70194 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clec4fP70194 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clec4fP70194 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clec4fP70194 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clec4fP70194 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clec4fP70194 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clec4fP70194 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Clec4fP70194 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clec4fP70194 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clec4fP70194 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clec4fP70194 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clec4fP70194 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clec4fP70194 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clec4fP70194 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clec4fP70194 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clec4fP70194 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clec4fP70194 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clec4fP70194 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clec4fP70194 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clec4fP70194 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clec4fP70194 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clec4fP70194 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clec4fP70194 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clec4fP70194 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clec4fP70194 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clec4fP70194 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clec4fP70194 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms