Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Actg1P63260 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Actg1P63260 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Actg1P63260 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Actg1P63260 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Actg1P63260 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Actg1P63260 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Actg1P63260 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actg1P63260 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Actg1P63260 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Actg1P63260 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Actg1P63260 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Actg1P63260 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Actg1P63260 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Actg1P63260 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Actg1P63260 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Actg1P63260 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Actg1P63260 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Actg1P63260 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Actg1P63260 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Actg1P63260 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Actg1P63260 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Actg1P63260 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Actg1P63260 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Actg1P63260 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Actg1P63260 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Actg1P63260 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Actg1P63260 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Actg1P63260 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Actg1P63260 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Actg1P63260 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Actg1P63260 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Actg1P63260 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Actg1P63260 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Actg1P63260 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Actg1P63260 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Actg1P63260 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Actg1P63260 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Actg1P63260 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Actg1P63260 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Actg1P63260 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Actg1P63260 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Actg1P63260 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Actg1P63260 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Actg1P63260 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Actg1P63260 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Actg1P63260 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Actg1P63260 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Actg1P63260 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Actg1P63260 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Actg1P63260 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Actg1P63260 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Actg1P63260 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Actg1P63260 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Actg1P63260 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Actg1P63260 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Actg1P63260 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Actg1P63260 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Actg1P63260 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Actg1P63260 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Actg1P63260 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Actg1P63260 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Actg1P63260 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Actg1P63260 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Actg1P63260 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Actg1P63260 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Actg1P63260 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Actg1P63260 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Actg1P63260 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Actg1P63260 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Actg1P63260 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Actg1P63260 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Actg1P63260 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Actg1P63260 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Actg1P63260 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Actg1P63260 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Actg1P63260 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Actg1P63260 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Actg1P63260 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Actg1P63260 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Actg1P63260 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Actg1P63260 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Actg1P63260 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Actg1P63260 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Actg1P63260 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Actg1P63260 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Actg1P63260 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Actg1P63260 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Actg1P63260 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Actg1P63260 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Actg1P63260 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Actg1P63260 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Actg1P63260 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Actg1P63260 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Actg1P63260 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Actg1P63260 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Actg1P63260 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Actg1P63260 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Actg1P63260 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Actg1P63260 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms