Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtnP63089 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtnP63089 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtnP63089 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PtnP63089 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtnP63089 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtnP63089 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtnP63089 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtnP63089 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtnP63089 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtnP63089 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtnP63089 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtnP63089 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtnP63089 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtnP63089 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtnP63089 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtnP63089 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtnP63089 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtnP63089 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtnP63089 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtnP63089 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtnP63089 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtnP63089 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtnP63089 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PtnP63089 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PtnP63089 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtnP63089 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtnP63089 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtnP63089 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PtnP63089 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtnP63089 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtnP63089 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtnP63089 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtnP63089 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtnP63089 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtnP63089 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtnP63089 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PtnP63089 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtnP63089 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtnP63089 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtnP63089 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtnP63089 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtnP63089 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtnP63089 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtnP63089 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtnP63089 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtnP63089 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtnP63089 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtnP63089 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtnP63089 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtnP63089 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtnP63089 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtnP63089 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PtnP63089 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtnP63089 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtnP63089 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PtnP63089 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtnP63089 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtnP63089 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtnP63089 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtnP63089 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtnP63089 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtnP63089 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtnP63089 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtnP63089 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtnP63089 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtnP63089 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtnP63089 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtnP63089 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtnP63089 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtnP63089 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtnP63089 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtnP63089 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtnP63089 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtnP63089 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtnP63089 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtnP63089 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtnP63089 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtnP63089 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtnP63089 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtnP63089 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtnP63089 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtnP63089 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtnP63089 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtnP63089 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtnP63089 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtnP63089 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtnP63089 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtnP63089 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PtnP63089 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PtnP63089 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtnP63089 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtnP63089 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PtnP63089 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtnP63089 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtnP63089 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtnP63089 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtnP63089 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PtnP63089 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtnP63089 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms