Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vamp3P63024 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vamp3P63024 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vamp3P63024 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vamp3P63024 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Vamp3P63024 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vamp3P63024 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vamp3P63024 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vamp3P63024 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vamp3P63024 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vamp3P63024 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp3P63024 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vamp3P63024 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp3P63024 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp3P63024 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp3P63024 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp3P63024 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp3P63024 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp3P63024 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp3P63024 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp3P63024 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp3P63024 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp3P63024 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp3P63024 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp3P63024 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp3P63024 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp3P63024 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp3P63024 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp3P63024 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp3P63024 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vamp3P63024 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vamp3P63024 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vamp3P63024 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vamp3P63024 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vamp3P63024 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vamp3P63024 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vamp3P63024 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vamp3P63024 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vamp3P63024 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vamp3P63024 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vamp3P63024 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vamp3P63024 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vamp3P63024 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vamp3P63024 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vamp3P63024 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vamp3P63024 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vamp3P63024 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vamp3P63024 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp3P63024 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp3P63024 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp3P63024 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp3P63024 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp3P63024 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vamp3P63024 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vamp3P63024 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp3P63024 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp3P63024 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp3P63024 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp3P63024 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp3P63024 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp3P63024 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp3P63024 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp3P63024 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp3P63024 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp3P63024 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp3P63024 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp3P63024 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp3P63024 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp3P63024 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp3P63024 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp3P63024 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp3P63024 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp3P63024 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp3P63024 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp3P63024 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp3P63024 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp3P63024 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp3P63024 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp3P63024 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp3P63024 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp3P63024 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp3P63024 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp3P63024 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp3P63024 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp3P63024 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp3P63024 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp3P63024 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp3P63024 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp3P63024 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp3P63024 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp3P63024 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp3P63024 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp3P63024 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp3P63024 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp3P63024 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp3P63024 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp3P63024 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp3P63024 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp3P63024 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp3P63024 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms