Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uba52P62984 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uba52P62984 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uba52P62984 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Uba52P62984 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Uba52P62984 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uba52P62984 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uba52P62984 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uba52P62984 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uba52P62984 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uba52P62984 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uba52P62984 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uba52P62984 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Uba52P62984 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uba52P62984 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uba52P62984 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uba52P62984 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uba52P62984 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uba52P62984 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uba52P62984 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uba52P62984 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uba52P62984 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uba52P62984 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uba52P62984 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uba52P62984 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uba52P62984 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uba52P62984 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uba52P62984 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uba52P62984 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Uba52P62984 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uba52P62984 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Uba52P62984 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uba52P62984 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uba52P62984 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uba52P62984 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Uba52P62984 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uba52P62984 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uba52P62984 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Uba52P62984 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uba52P62984 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Uba52P62984 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uba52P62984 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uba52P62984 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uba52P62984 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uba52P62984 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uba52P62984 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uba52P62984 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uba52P62984 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uba52P62984 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Uba52P62984 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uba52P62984 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Uba52P62984 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uba52P62984 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Uba52P62984 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uba52P62984 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uba52P62984 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uba52P62984 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Uba52P62984 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Uba52P62984 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Uba52P62984 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Uba52P62984 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uba52P62984 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uba52P62984 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Uba52P62984 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uba52P62984 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uba52P62984 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Uba52P62984 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Uba52P62984 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Uba52P62984 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uba52P62984 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uba52P62984 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uba52P62984 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uba52P62984 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uba52P62984 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Uba52P62984 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Uba52P62984 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Uba52P62984 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Uba52P62984 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Uba52P62984 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Uba52P62984 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Uba52P62984 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Uba52P62984 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Uba52P62984 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Uba52P62984 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Uba52P62984 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Uba52P62984 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Uba52P62984 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Uba52P62984 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uba52P62984 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uba52P62984 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Uba52P62984 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uba52P62984 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uba52P62984 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uba52P62984 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uba52P62984 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uba52P62984 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uba52P62984 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uba52P62984 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uba52P62984 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uba52P62984 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms