Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lsm3P62311 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lsm3P62311 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lsm3P62311 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lsm3P62311 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lsm3P62311 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lsm3P62311 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lsm3P62311 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lsm3P62311 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lsm3P62311 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lsm3P62311 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lsm3P62311 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lsm3P62311 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lsm3P62311 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lsm3P62311 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lsm3P62311 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lsm3P62311 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lsm3P62311 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lsm3P62311 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lsm3P62311 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lsm3P62311 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lsm3P62311 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lsm3P62311 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lsm3P62311 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lsm3P62311 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lsm3P62311 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lsm3P62311 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lsm3P62311 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lsm3P62311 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lsm3P62311 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lsm3P62311 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lsm3P62311 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lsm3P62311 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lsm3P62311 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lsm3P62311 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lsm3P62311 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lsm3P62311 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lsm3P62311 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lsm3P62311 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lsm3P62311 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lsm3P62311 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lsm3P62311 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lsm3P62311 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lsm3P62311 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lsm3P62311 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lsm3P62311 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lsm3P62311 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lsm3P62311 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lsm3P62311 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lsm3P62311 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lsm3P62311 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lsm3P62311 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lsm3P62311 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lsm3P62311 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lsm3P62311 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lsm3P62311 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lsm3P62311 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lsm3P62311 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lsm3P62311 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lsm3P62311 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lsm3P62311 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lsm3P62311 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lsm3P62311 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lsm3P62311 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lsm3P62311 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lsm3P62311 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lsm3P62311 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lsm3P62311 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lsm3P62311 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lsm3P62311 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lsm3P62311 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lsm3P62311 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lsm3P62311 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lsm3P62311 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lsm3P62311 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lsm3P62311 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lsm3P62311 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lsm3P62311 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lsm3P62311 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lsm3P62311 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lsm3P62311 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lsm3P62311 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lsm3P62311 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lsm3P62311 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lsm3P62311 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lsm3P62311 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lsm3P62311 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lsm3P62311 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lsm3P62311 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lsm3P62311 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lsm3P62311 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lsm3P62311 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lsm3P62311 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lsm3P62311 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lsm3P62311 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lsm3P62311 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lsm3P62311 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lsm3P62311 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lsm3P62311 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lsm3P62311 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms