Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp46P62069 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp46P62069 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp46P62069 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp46P62069 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp46P62069 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp46P62069 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp46P62069 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp46P62069 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp46P62069 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp46P62069 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp46P62069 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp46P62069 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp46P62069 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp46P62069 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp46P62069 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp46P62069 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp46P62069 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp46P62069 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp46P62069 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp46P62069 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp46P62069 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp46P62069 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp46P62069 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp46P62069 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp46P62069 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp46P62069 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp46P62069 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp46P62069 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp46P62069 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp46P62069 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp46P62069 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp46P62069 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp46P62069 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp46P62069 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp46P62069 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp46P62069 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp46P62069 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp46P62069 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp46P62069 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp46P62069 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp46P62069 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp46P62069 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp46P62069 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp46P62069 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp46P62069 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp46P62069 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp46P62069 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp46P62069 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp46P62069 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp46P62069 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp46P62069 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp46P62069 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp46P62069 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp46P62069 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp46P62069 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp46P62069 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp46P62069 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp46P62069 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp46P62069 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp46P62069 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp46P62069 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp46P62069 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp46P62069 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp46P62069 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp46P62069 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp46P62069 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp46P62069 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp46P62069 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp46P62069 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp46P62069 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp46P62069 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp46P62069 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp46P62069 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp46P62069 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp46P62069 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp46P62069 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp46P62069 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp46P62069 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp46P62069 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp46P62069 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp46P62069 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp46P62069 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp46P62069 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp46P62069 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp46P62069 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp46P62069 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp46P62069 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp46P62069 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp46P62069 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp46P62069 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp46P62069 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp46P62069 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp46P62069 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp46P62069 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp46P62069 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp46P62069 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Usp46P62069 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp46P62069 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp46P62069 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms