Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf13P61216 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf13P61216 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf13P61216 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf13P61216 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf13P61216 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf13P61216 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf13P61216 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf13P61216 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf13P61216 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf13P61216 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf13P61216 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf13P61216 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf13P61216 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf13P61216 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf13P61216 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf13P61216 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf13P61216 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf13P61216 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf13P61216 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf13P61216 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf13P61216 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf13P61216 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf13P61216 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf13P61216 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf13P61216 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf13P61216 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf13P61216 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf13P61216 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf13P61216 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf13P61216 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf13P61216 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf13P61216 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf13P61216 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf13P61216 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf13P61216 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf13P61216 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf13P61216 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf13P61216 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf13P61216 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf13P61216 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf13P61216 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf13P61216 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Taf13P61216 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Taf13P61216 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf13P61216 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf13P61216 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf13P61216 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf13P61216 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf13P61216 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf13P61216 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf13P61216 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf13P61216 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf13P61216 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf13P61216 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf13P61216 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf13P61216 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf13P61216 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Taf13P61216 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Taf13P61216 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf13P61216 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf13P61216 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf13P61216 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf13P61216 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf13P61216 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf13P61216 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf13P61216 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf13P61216 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf13P61216 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf13P61216 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf13P61216 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf13P61216 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf13P61216 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf13P61216 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Taf13P61216 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf13P61216 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf13P61216 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf13P61216 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Taf13P61216 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Taf13P61216 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Taf13P61216 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Taf13P61216 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Taf13P61216 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf13P61216 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf13P61216 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf13P61216 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf13P61216 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf13P61216 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf13P61216 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf13P61216 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf13P61216 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf13P61216 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf13P61216 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf13P61216 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf13P61216 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf13P61216 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf13P61216 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf13P61216 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf13P61216 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf13P61216 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms