Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pcmtd1P59913 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pcmtd1P59913 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pcmtd1P59913 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pcmtd1P59913 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pcmtd1P59913 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pcmtd1P59913 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pcmtd1P59913 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pcmtd1P59913 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pcmtd1P59913 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pcmtd1P59913 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pcmtd1P59913 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pcmtd1P59913 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Pcmtd1P59913 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pcmtd1P59913 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pcmtd1P59913 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pcmtd1P59913 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pcmtd1P59913 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pcmtd1P59913 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pcmtd1P59913 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pcmtd1P59913 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pcmtd1P59913 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Pcmtd1P59913 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pcmtd1P59913 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pcmtd1P59913 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pcmtd1P59913 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pcmtd1P59913 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pcmtd1P59913 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pcmtd1P59913 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pcmtd1P59913 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pcmtd1P59913 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pcmtd1P59913 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pcmtd1P59913 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pcmtd1P59913 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pcmtd1P59913 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pcmtd1P59913 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pcmtd1P59913 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pcmtd1P59913 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pcmtd1P59913 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pcmtd1P59913 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pcmtd1P59913 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pcmtd1P59913 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pcmtd1P59913 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pcmtd1P59913 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pcmtd1P59913 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pcmtd1P59913 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pcmtd1P59913 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pcmtd1P59913 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pcmtd1P59913 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pcmtd1P59913 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pcmtd1P59913 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pcmtd1P59913 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pcmtd1P59913 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pcmtd1P59913 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pcmtd1P59913 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pcmtd1P59913 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pcmtd1P59913 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Pcmtd1P59913 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pcmtd1P59913 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pcmtd1P59913 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pcmtd1P59913 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Pcmtd1P59913 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pcmtd1P59913 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pcmtd1P59913 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pcmtd1P59913 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pcmtd1P59913 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pcmtd1P59913 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pcmtd1P59913 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pcmtd1P59913 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pcmtd1P59913 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pcmtd1P59913 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pcmtd1P59913 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pcmtd1P59913 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pcmtd1P59913 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pcmtd1P59913 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pcmtd1P59913 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pcmtd1P59913 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pcmtd1P59913 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Pcmtd1P59913 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pcmtd1P59913 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcmtd1P59913 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcmtd1P59913 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pcmtd1P59913 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pcmtd1P59913 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pcmtd1P59913 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pcmtd1P59913 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pcmtd1P59913 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pcmtd1P59913 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pcmtd1P59913 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pcmtd1P59913 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Pcmtd1P59913 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pcmtd1P59913 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pcmtd1P59913 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pcmtd1P59913 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pcmtd1P59913 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pcmtd1P59913 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pcmtd1P59913 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pcmtd1P59913 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pcmtd1P59913 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Pcmtd1P59913 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms