Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NcstnP57716 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NcstnP57716 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NcstnP57716 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NcstnP57716 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NcstnP57716 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NcstnP57716 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NcstnP57716 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NcstnP57716 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NcstnP57716 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NcstnP57716 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NcstnP57716 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NcstnP57716 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NcstnP57716 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NcstnP57716 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NcstnP57716 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NcstnP57716 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NcstnP57716 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NcstnP57716 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NcstnP57716 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NcstnP57716 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NcstnP57716 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NcstnP57716 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NcstnP57716 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NcstnP57716 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NcstnP57716 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NcstnP57716 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NcstnP57716 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NcstnP57716 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NcstnP57716 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NcstnP57716 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NcstnP57716 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NcstnP57716 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NcstnP57716 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NcstnP57716 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NcstnP57716 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NcstnP57716 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NcstnP57716 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NcstnP57716 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NcstnP57716 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NcstnP57716 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NcstnP57716 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NcstnP57716 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NcstnP57716 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NcstnP57716 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NcstnP57716 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NcstnP57716 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NcstnP57716 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NcstnP57716 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NcstnP57716 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NcstnP57716 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NcstnP57716 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NcstnP57716 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NcstnP57716 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NcstnP57716 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NcstnP57716 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NcstnP57716 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NcstnP57716 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NcstnP57716 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NcstnP57716 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NcstnP57716 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NcstnP57716 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NcstnP57716 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NcstnP57716 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NcstnP57716 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NcstnP57716 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NcstnP57716 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NcstnP57716 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NcstnP57716 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NcstnP57716 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NcstnP57716 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NcstnP57716 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NcstnP57716 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NcstnP57716 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NcstnP57716 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NcstnP57716 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NcstnP57716 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NcstnP57716 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NcstnP57716 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NcstnP57716 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NcstnP57716 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NcstnP57716 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NcstnP57716 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NcstnP57716 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NcstnP57716 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NcstnP57716 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NcstnP57716 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NcstnP57716 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NcstnP57716 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NcstnP57716 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NcstnP57716 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NcstnP57716 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NcstnP57716 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NcstnP57716 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NcstnP57716 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NcstnP57716 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NcstnP57716 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NcstnP57716 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NcstnP57716 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NcstnP57716 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms