Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fdft1P53798 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fdft1P53798 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fdft1P53798 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fdft1P53798 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Fdft1P53798 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Fdft1P53798 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fdft1P53798 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fdft1P53798 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fdft1P53798 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fdft1P53798 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fdft1P53798 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fdft1P53798 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fdft1P53798 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fdft1P53798 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fdft1P53798 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fdft1P53798 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fdft1P53798 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fdft1P53798 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fdft1P53798 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fdft1P53798 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fdft1P53798 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fdft1P53798 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fdft1P53798 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fdft1P53798 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fdft1P53798 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fdft1P53798 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fdft1P53798 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fdft1P53798 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fdft1P53798 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fdft1P53798 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fdft1P53798 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fdft1P53798 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fdft1P53798 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fdft1P53798 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fdft1P53798 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fdft1P53798 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fdft1P53798 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fdft1P53798 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fdft1P53798 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fdft1P53798 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fdft1P53798 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fdft1P53798 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fdft1P53798 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fdft1P53798 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fdft1P53798 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fdft1P53798 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fdft1P53798 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fdft1P53798 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fdft1P53798 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fdft1P53798 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fdft1P53798 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fdft1P53798 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Fdft1P53798 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fdft1P53798 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fdft1P53798 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fdft1P53798 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fdft1P53798 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Fdft1P53798 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fdft1P53798 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Fdft1P53798 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fdft1P53798 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fdft1P53798 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fdft1P53798 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fdft1P53798 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fdft1P53798 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fdft1P53798 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fdft1P53798 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fdft1P53798 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Fdft1P53798 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fdft1P53798 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fdft1P53798 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fdft1P53798 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fdft1P53798 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fdft1P53798 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fdft1P53798 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fdft1P53798 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fdft1P53798 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fdft1P53798 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fdft1P53798 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fdft1P53798 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fdft1P53798 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fdft1P53798 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fdft1P53798 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fdft1P53798 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fdft1P53798 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fdft1P53798 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fdft1P53798 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fdft1P53798 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fdft1P53798 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Fdft1P53798 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fdft1P53798 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fdft1P53798 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fdft1P53798 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fdft1P53798 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fdft1P53798 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fdft1P53798 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fdft1P53798 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fdft1P53798 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fdft1P53798 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.5 ms