Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Defa11P50709 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Defa11P50709 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Defa11P50709 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Defa11P50709 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Defa11P50709 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Defa11P50709 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Defa11P50709 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Defa11P50709 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Defa11P50709 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Defa11P50709 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Defa11P50709 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Defa11P50709 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Defa11P50709 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Defa11P50709 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Defa11P50709 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Defa11P50709 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Defa11P50709 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Defa11P50709 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Defa11P50709 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Defa11P50709 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Defa11P50709 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Defa11P50709 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Defa11P50709 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Defa11P50709 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Defa11P50709 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Defa11P50709 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Defa11P50709 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Defa11P50709 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Defa11P50709 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Defa11P50709 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Defa11P50709 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Defa11P50709 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Defa11P50709 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Defa11P50709 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Defa11P50709 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Defa11P50709 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Defa11P50709 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Defa11P50709 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Defa11P50709 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Defa11P50709 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Defa11P50709 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Defa11P50709 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Defa11P50709 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Defa11P50709 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Defa11P50709 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Defa11P50709 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Defa11P50709 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Defa11P50709 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Defa11P50709 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Defa11P50709 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Defa11P50709 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Defa11P50709 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Defa11P50709 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Defa11P50709 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Defa11P50709 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Defa11P50709 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Defa11P50709 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Defa11P50709 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Defa11P50709 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Defa11P50709 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Defa11P50709 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Defa11P50709 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Defa11P50709 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Defa11P50709 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Defa11P50709 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Defa11P50709 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Defa11P50709 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Defa11P50709 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Defa11P50709 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Defa11P50709 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Defa11P50709 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Defa11P50709 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Defa11P50709 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Defa11P50709 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Defa11P50709 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Defa11P50709 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Defa11P50709 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Defa11P50709 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa11P50709 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa11P50709 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa11P50709 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defa11P50709 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defa11P50709 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Defa11P50709 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Defa11P50709 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Defa11P50709 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defa11P50709 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Defa11P50709 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defa11P50709 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Defa11P50709 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Defa11P50709 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Defa11P50709 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Defa11P50709 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Defa11P50709 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Defa11P50709 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Defa11P50709 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defa11P50709 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defa11P50709 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defa11P50709 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.8 ms