Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Defa8P50706 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Defa8P50706 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Defa8P50706 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Defa8P50706 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Defa8P50706 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Defa8P50706 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Defa8P50706 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Defa8P50706 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Defa8P50706 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Defa8P50706 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Defa8P50706 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Defa8P50706 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Defa8P50706 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Defa8P50706 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Defa8P50706 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Defa8P50706 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Defa8P50706 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Defa8P50706 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Defa8P50706 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Defa8P50706 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Defa8P50706 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Defa8P50706 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Defa8P50706 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Defa8P50706 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Defa8P50706 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Defa8P50706 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Defa8P50706 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Defa8P50706 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Defa8P50706 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Defa8P50706 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Defa8P50706 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Defa8P50706 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Defa8P50706 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Defa8P50706 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Defa8P50706 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Defa8P50706 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Defa8P50706 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Defa8P50706 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Defa8P50706 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Defa8P50706 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Defa8P50706 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Defa8P50706 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Defa8P50706 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Defa8P50706 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Defa8P50706 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Defa8P50706 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Defa8P50706 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Defa8P50706 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Defa8P50706 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Defa8P50706 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Defa8P50706 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Defa8P50706 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Defa8P50706 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Defa8P50706 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Defa8P50706 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Defa8P50706 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Defa8P50706 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Defa8P50706 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Defa8P50706 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Defa8P50706 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Defa8P50706 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Defa8P50706 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Defa8P50706 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Defa8P50706 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Defa8P50706 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Defa8P50706 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Defa8P50706 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Defa8P50706 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Defa8P50706 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Defa8P50706 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Defa8P50706 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Defa8P50706 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Defa8P50706 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Defa8P50706 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Defa8P50706 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Defa8P50706 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Defa8P50706 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Defa8P50706 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Defa8P50706 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Defa8P50706 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Defa8P50706 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Defa8P50706 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Defa8P50706 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Defa8P50706 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Defa8P50706 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Defa8P50706 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Defa8P50706 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Defa8P50706 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Defa8P50706 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Defa8P50706 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Defa8P50706 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Defa8P50706 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Defa8P50706 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Defa8P50706 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Defa8P50706 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Defa8P50706 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Defa8P50706 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Defa8P50706 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Defa8P50706 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms