Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FmodP50608 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FmodP50608 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FmodP50608 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FmodP50608 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FmodP50608 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FmodP50608 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FmodP50608 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FmodP50608 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FmodP50608 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FmodP50608 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FmodP50608 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FmodP50608 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FmodP50608 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FmodP50608 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FmodP50608 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FmodP50608 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FmodP50608 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
FmodP50608 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FmodP50608 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FmodP50608 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FmodP50608 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FmodP50608 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FmodP50608 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FmodP50608 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FmodP50608 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FmodP50608 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FmodP50608 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FmodP50608 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FmodP50608 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FmodP50608 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FmodP50608 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FmodP50608 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FmodP50608 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FmodP50608 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FmodP50608 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FmodP50608 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FmodP50608 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FmodP50608 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FmodP50608 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FmodP50608 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FmodP50608 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FmodP50608 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FmodP50608 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FmodP50608 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FmodP50608 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FmodP50608 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FmodP50608 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FmodP50608 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FmodP50608 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FmodP50608 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FmodP50608 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FmodP50608 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FmodP50608 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FmodP50608 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FmodP50608 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FmodP50608 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FmodP50608 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FmodP50608 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FmodP50608 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FmodP50608 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FmodP50608 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FmodP50608 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FmodP50608 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FmodP50608 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FmodP50608 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FmodP50608 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FmodP50608 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FmodP50608 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FmodP50608 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FmodP50608 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FmodP50608 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FmodP50608 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FmodP50608 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FmodP50608 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FmodP50608 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FmodP50608 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FmodP50608 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FmodP50608 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FmodP50608 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FmodP50608 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FmodP50608 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
FmodP50608 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FmodP50608 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FmodP50608 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FmodP50608 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FmodP50608 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FmodP50608 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FmodP50608 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FmodP50608 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FmodP50608 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FmodP50608 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FmodP50608 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FmodP50608 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FmodP50608 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FmodP50608 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FmodP50608 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FmodP50608 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FmodP50608 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FmodP50608 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms