Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rfx2P48379 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rfx2P48379 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rfx2P48379 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Rfx2P48379 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rfx2P48379 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rfx2P48379 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rfx2P48379 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rfx2P48379 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rfx2P48379 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rfx2P48379 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rfx2P48379 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Rfx2P48379 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rfx2P48379 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rfx2P48379 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Rfx2P48379 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rfx2P48379 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rfx2P48379 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rfx2P48379 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rfx2P48379 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rfx2P48379 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rfx2P48379 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rfx2P48379 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rfx2P48379 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rfx2P48379 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rfx2P48379 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rfx2P48379 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rfx2P48379 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rfx2P48379 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rfx2P48379 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rfx2P48379 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rfx2P48379 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Rfx2P48379 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rfx2P48379 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rfx2P48379 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rfx2P48379 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rfx2P48379 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rfx2P48379 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rfx2P48379 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rfx2P48379 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rfx2P48379 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rfx2P48379 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rfx2P48379 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rfx2P48379 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rfx2P48379 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rfx2P48379 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rfx2P48379 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rfx2P48379 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rfx2P48379 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rfx2P48379 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rfx2P48379 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rfx2P48379 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rfx2P48379 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rfx2P48379 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rfx2P48379 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rfx2P48379 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rfx2P48379 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rfx2P48379 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rfx2P48379 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Rfx2P48379 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rfx2P48379 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Rfx2P48379 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rfx2P48379 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rfx2P48379 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rfx2P48379 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rfx2P48379 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rfx2P48379 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rfx2P48379 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rfx2P48379 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rfx2P48379 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rfx2P48379 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rfx2P48379 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rfx2P48379 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rfx2P48379 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rfx2P48379 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Rfx2P48379 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Rfx2P48379 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rfx2P48379 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rfx2P48379 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rfx2P48379 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rfx2P48379 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rfx2P48379 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rfx2P48379 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rfx2P48379 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rfx2P48379 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rfx2P48379 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rfx2P48379 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rfx2P48379 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rfx2P48379 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rfx2P48379 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rfx2P48379 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rfx2P48379 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rfx2P48379 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rfx2P48379 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rfx2P48379 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rfx2P48379 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rfx2P48379 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rfx2P48379 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rfx2P48379 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rfx2P48379 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms