Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sdc2P43407 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sdc2P43407 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sdc2P43407 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Sdc2P43407 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sdc2P43407 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sdc2P43407 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sdc2P43407 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sdc2P43407 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sdc2P43407 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sdc2P43407 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sdc2P43407 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Sdc2P43407 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sdc2P43407 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sdc2P43407 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Sdc2P43407 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sdc2P43407 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sdc2P43407 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sdc2P43407 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sdc2P43407 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Sdc2P43407 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sdc2P43407 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sdc2P43407 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sdc2P43407 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sdc2P43407 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sdc2P43407 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sdc2P43407 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sdc2P43407 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sdc2P43407 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sdc2P43407 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sdc2P43407 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Sdc2P43407 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sdc2P43407 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sdc2P43407 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sdc2P43407 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sdc2P43407 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sdc2P43407 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sdc2P43407 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sdc2P43407 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sdc2P43407 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sdc2P43407 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sdc2P43407 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sdc2P43407 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sdc2P43407 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sdc2P43407 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sdc2P43407 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sdc2P43407 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sdc2P43407 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sdc2P43407 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sdc2P43407 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sdc2P43407 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sdc2P43407 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sdc2P43407 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sdc2P43407 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sdc2P43407 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sdc2P43407 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sdc2P43407 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Sdc2P43407 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Sdc2P43407 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sdc2P43407 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sdc2P43407 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sdc2P43407 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sdc2P43407 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sdc2P43407 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sdc2P43407 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sdc2P43407 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sdc2P43407 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sdc2P43407 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sdc2P43407 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sdc2P43407 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Sdc2P43407 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sdc2P43407 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sdc2P43407 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sdc2P43407 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sdc2P43407 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sdc2P43407 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sdc2P43407 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sdc2P43407 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sdc2P43407 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sdc2P43407 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sdc2P43407 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sdc2P43407 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sdc2P43407 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sdc2P43407 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sdc2P43407 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sdc2P43407 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Sdc2P43407 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sdc2P43407 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sdc2P43407 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sdc2P43407 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sdc2P43407 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sdc2P43407 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sdc2P43407 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sdc2P43407 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sdc2P43407 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sdc2P43407 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sdc2P43407 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sdc2P43407 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sdc2P43407 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sdc2P43407 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms