Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
Chd1P40201 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
Chd1P40201 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
Chd1P40201 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
Chd1P40201 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Chd1P40201 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
Chd1P40201 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Chd1P40201 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Chd1P40201 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
Chd1P40201 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
Chd1P40201 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
Chd1P40201 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Chd1P40201 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
Chd1P40201 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Chd1P40201 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Chd1P40201 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
Chd1P40201 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
Chd1P40201 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Chd1P40201 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Chd1P40201 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Chd1P40201 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Chd1P40201 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.72■■■■■ 4.11
Chd1P40201 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Chd1P40201 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
Chd1P40201 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Chd1P40201 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Chd1P40201 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Chd1P40201 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Chd1P40201 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
Chd1P40201 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
Chd1P40201 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
Chd1P40201 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Chd1P40201 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
Chd1P40201 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Chd1P40201 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Chd1P40201 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
Chd1P40201 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Chd1P40201 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
Chd1P40201 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Chd1P40201 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Chd1P40201 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
Chd1P40201 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Chd1P40201 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Chd1P40201 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
Chd1P40201 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
Chd1P40201 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
Chd1P40201 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Chd1P40201 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Chd1P40201 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Chd1P40201 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
Chd1P40201 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Chd1P40201 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC40.42■■■■■ 4.06
Chd1P40201 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
Chd1P40201 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Chd1P40201 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Chd1P40201 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Chd1P40201 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
Chd1P40201 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Chd1P40201 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
Chd1P40201 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Chd1P40201 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
Chd1P40201 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Chd1P40201 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Chd1P40201 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.3■■■■■ 4.04
Chd1P40201 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Chd1P40201 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Chd1P40201 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Chd1P40201 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Chd1P40201 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
Chd1P40201 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC40.28■■■■■ 4.04
Chd1P40201 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Chd1P40201 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
Chd1P40201 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
Chd1P40201 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Chd1P40201 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Chd1P40201 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Chd1P40201 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Chd1P40201 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Chd1P40201 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Chd1P40201 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Chd1P40201 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
Chd1P40201 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Chd1P40201 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
Chd1P40201 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Chd1P40201 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Chd1P40201 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Chd1P40201 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Chd1P40201 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Chd1P40201 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
Chd1P40201 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Chd1P40201 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC40.12■■■■■ 4.01
Chd1P40201 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC40.12■■■■■ 4.01
Chd1P40201 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Chd1P40201 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Chd1P40201 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Chd1P40201 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC40.03■■■■■ 4
Chd1P40201 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Chd1P40201 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Chd1P40201 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Chd1P40201 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms