Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Traf2P39429 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Traf2P39429 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Traf2P39429 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Traf2P39429 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Traf2P39429 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Traf2P39429 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Traf2P39429 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Traf2P39429 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Traf2P39429 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Traf2P39429 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Traf2P39429 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Traf2P39429 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Traf2P39429 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Traf2P39429 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Traf2P39429 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Traf2P39429 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Traf2P39429 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Traf2P39429 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Traf2P39429 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Traf2P39429 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Traf2P39429 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Traf2P39429 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Traf2P39429 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Traf2P39429 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Traf2P39429 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Traf2P39429 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Traf2P39429 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Traf2P39429 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Traf2P39429 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Traf2P39429 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Traf2P39429 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Traf2P39429 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Traf2P39429 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Traf2P39429 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Traf2P39429 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Traf2P39429 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Traf2P39429 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Traf2P39429 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Traf2P39429 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Traf2P39429 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Traf2P39429 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Traf2P39429 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Traf2P39429 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Traf2P39429 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Traf2P39429 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Traf2P39429 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Traf2P39429 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Traf2P39429 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Traf2P39429 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Traf2P39429 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Traf2P39429 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Traf2P39429 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Traf2P39429 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Traf2P39429 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Traf2P39429 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Traf2P39429 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Traf2P39429 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Traf2P39429 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Traf2P39429 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Traf2P39429 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Traf2P39429 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Traf2P39429 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Traf2P39429 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Traf2P39429 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Traf2P39429 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Traf2P39429 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Traf2P39429 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Traf2P39429 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Traf2P39429 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Traf2P39429 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Traf2P39429 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Traf2P39429 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Traf2P39429 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Traf2P39429 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Traf2P39429 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Traf2P39429 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Traf2P39429 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Traf2P39429 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Traf2P39429 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Traf2P39429 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Traf2P39429 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Traf2P39429 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Traf2P39429 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Traf2P39429 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Traf2P39429 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Traf2P39429 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Traf2P39429 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Traf2P39429 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Traf2P39429 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Traf2P39429 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Traf2P39429 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Traf2P39429 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Traf2P39429 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Traf2P39429 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Traf2P39429 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Traf2P39429 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Traf2P39429 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Traf2P39429 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Traf2P39429 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms