Protein–RNA interactions for Protein: P35283

Rab12, Ras-related protein Rab-12, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab12P35283 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab12P35283 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab12P35283 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rab12P35283 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rab12P35283 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rab12P35283 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab12P35283 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab12P35283 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab12P35283 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab12P35283 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab12P35283 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab12P35283 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab12P35283 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab12P35283 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab12P35283 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab12P35283 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab12P35283 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab12P35283 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab12P35283 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab12P35283 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab12P35283 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab12P35283 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab12P35283 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab12P35283 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab12P35283 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab12P35283 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab12P35283 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab12P35283 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab12P35283 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab12P35283 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab12P35283 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab12P35283 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab12P35283 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab12P35283 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab12P35283 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab12P35283 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab12P35283 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab12P35283 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab12P35283 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rab12P35283 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rab12P35283 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab12P35283 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab12P35283 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab12P35283 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab12P35283 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab12P35283 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab12P35283 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab12P35283 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab12P35283 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab12P35283 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab12P35283 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab12P35283 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab12P35283 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab12P35283 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab12P35283 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab12P35283 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab12P35283 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab12P35283 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab12P35283 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab12P35283 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab12P35283 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab12P35283 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab12P35283 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab12P35283 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab12P35283 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab12P35283 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab12P35283 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab12P35283 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rab12P35283 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab12P35283 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab12P35283 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab12P35283 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab12P35283 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab12P35283 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab12P35283 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab12P35283 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab12P35283 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab12P35283 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab12P35283 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab12P35283 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab12P35283 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab12P35283 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab12P35283 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab12P35283 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab12P35283 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab12P35283 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab12P35283 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab12P35283 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab12P35283 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab12P35283 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab12P35283 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab12P35283 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab12P35283 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab12P35283 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab12P35283 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab12P35283 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab12P35283 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab12P35283 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab12P35283 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab12P35283 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms