Protein–RNA interactions for Protein: P32020

Scp2, Non-specific lipid-transfer protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2P32020 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Scp2P32020 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Scp2P32020 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Scp2P32020 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Scp2P32020 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Scp2P32020 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Scp2P32020 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Scp2P32020 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Scp2P32020 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Scp2P32020 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Scp2P32020 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Scp2P32020 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Scp2P32020 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Scp2P32020 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Scp2P32020 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Scp2P32020 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Scp2P32020 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Scp2P32020 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Scp2P32020 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Scp2P32020 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Scp2P32020 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Scp2P32020 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Scp2P32020 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Scp2P32020 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Scp2P32020 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Scp2P32020 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Scp2P32020 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Scp2P32020 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Scp2P32020 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Scp2P32020 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scp2P32020 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scp2P32020 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scp2P32020 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scp2P32020 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Scp2P32020 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Scp2P32020 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scp2P32020 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scp2P32020 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scp2P32020 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scp2P32020 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Scp2P32020 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scp2P32020 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scp2P32020 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Scp2P32020 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Scp2P32020 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Scp2P32020 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Scp2P32020 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Scp2P32020 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Scp2P32020 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Scp2P32020 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Scp2P32020 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Scp2P32020 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Scp2P32020 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Scp2P32020 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Scp2P32020 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Scp2P32020 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Scp2P32020 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Scp2P32020 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Scp2P32020 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Scp2P32020 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scp2P32020 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scp2P32020 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scp2P32020 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scp2P32020 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Scp2P32020 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Scp2P32020 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Scp2P32020 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Scp2P32020 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Scp2P32020 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Scp2P32020 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Scp2P32020 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Scp2P32020 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Scp2P32020 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Scp2P32020 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Scp2P32020 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Scp2P32020 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Scp2P32020 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Scp2P32020 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Scp2P32020 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Scp2P32020 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Scp2P32020 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Scp2P32020 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Scp2P32020 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Scp2P32020 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Scp2P32020 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Scp2P32020 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Scp2P32020 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Scp2P32020 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Scp2P32020 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Scp2P32020 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Scp2P32020 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Scp2P32020 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Scp2P32020 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Scp2P32020 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Scp2P32020 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Scp2P32020 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Scp2P32020 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Scp2P32020 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Scp2P32020 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Scp2P32020 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms