Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Saa4P31532 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Saa4P31532 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Saa4P31532 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Saa4P31532 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Saa4P31532 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Saa4P31532 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Saa4P31532 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Saa4P31532 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Saa4P31532 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Saa4P31532 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Saa4P31532 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Saa4P31532 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Saa4P31532 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Saa4P31532 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Saa4P31532 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Saa4P31532 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Saa4P31532 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Saa4P31532 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Saa4P31532 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Saa4P31532 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Saa4P31532 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Saa4P31532 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Saa4P31532 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Saa4P31532 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Saa4P31532 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Saa4P31532 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Saa4P31532 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Saa4P31532 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Saa4P31532 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Saa4P31532 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Saa4P31532 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Saa4P31532 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Saa4P31532 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Saa4P31532 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Saa4P31532 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Saa4P31532 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Saa4P31532 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Saa4P31532 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Saa4P31532 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Saa4P31532 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Saa4P31532 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Saa4P31532 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Saa4P31532 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Saa4P31532 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Saa4P31532 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Saa4P31532 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Saa4P31532 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Saa4P31532 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Saa4P31532 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Saa4P31532 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Saa4P31532 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Saa4P31532 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Saa4P31532 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Saa4P31532 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Saa4P31532 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Saa4P31532 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Saa4P31532 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Saa4P31532 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Saa4P31532 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Saa4P31532 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Saa4P31532 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Saa4P31532 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Saa4P31532 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Saa4P31532 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Saa4P31532 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Saa4P31532 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Saa4P31532 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Saa4P31532 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Saa4P31532 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Saa4P31532 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Saa4P31532 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Saa4P31532 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Saa4P31532 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Saa4P31532 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Saa4P31532 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Saa4P31532 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Saa4P31532 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Saa4P31532 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Saa4P31532 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Saa4P31532 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Saa4P31532 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Saa4P31532 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Saa4P31532 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Saa4P31532 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Saa4P31532 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Saa4P31532 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Saa4P31532 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Saa4P31532 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Saa4P31532 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Saa4P31532 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Saa4P31532 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Saa4P31532 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Saa4P31532 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Saa4P31532 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Saa4P31532 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Saa4P31532 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Saa4P31532 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Saa4P31532 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Saa4P31532 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms