Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxa2P31245 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxa2P31245 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxa2P31245 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxa2P31245 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxa2P31245 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxa2P31245 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxa2P31245 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxa2P31245 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxa2P31245 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxa2P31245 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxa2P31245 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxa2P31245 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxa2P31245 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxa2P31245 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxa2P31245 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxa2P31245 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxa2P31245 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxa2P31245 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxa2P31245 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxa2P31245 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxa2P31245 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxa2P31245 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxa2P31245 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxa2P31245 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hoxa2P31245 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxa2P31245 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxa2P31245 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxa2P31245 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxa2P31245 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxa2P31245 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxa2P31245 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxa2P31245 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxa2P31245 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxa2P31245 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxa2P31245 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxa2P31245 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxa2P31245 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxa2P31245 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxa2P31245 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxa2P31245 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxa2P31245 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxa2P31245 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxa2P31245 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxa2P31245 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxa2P31245 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxa2P31245 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxa2P31245 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxa2P31245 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxa2P31245 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxa2P31245 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxa2P31245 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxa2P31245 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxa2P31245 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxa2P31245 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxa2P31245 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxa2P31245 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxa2P31245 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxa2P31245 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxa2P31245 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxa2P31245 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxa2P31245 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxa2P31245 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxa2P31245 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxa2P31245 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxa2P31245 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxa2P31245 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxa2P31245 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxa2P31245 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxa2P31245 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxa2P31245 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxa2P31245 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxa2P31245 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxa2P31245 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxa2P31245 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxa2P31245 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxa2P31245 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxa2P31245 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxa2P31245 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxa2P31245 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxa2P31245 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxa2P31245 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxa2P31245 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxa2P31245 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxa2P31245 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxa2P31245 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxa2P31245 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxa2P31245 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxa2P31245 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxa2P31245 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxa2P31245 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxa2P31245 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxa2P31245 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxa2P31245 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxa2P31245 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxa2P31245 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxa2P31245 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxa2P31245 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxa2P31245 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxa2P31245 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms