Protein–RNA interactions for Protein: P28661

Sept4, Septin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept4P28661 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sept4P28661 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sept4P28661 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sept4P28661 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sept4P28661 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Sept4P28661 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sept4P28661 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Sept4P28661 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sept4P28661 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sept4P28661 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sept4P28661 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sept4P28661 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sept4P28661 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Sept4P28661 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Sept4P28661 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sept4P28661 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sept4P28661 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Sept4P28661 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sept4P28661 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sept4P28661 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sept4P28661 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sept4P28661 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sept4P28661 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sept4P28661 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sept4P28661 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sept4P28661 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sept4P28661 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sept4P28661 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sept4P28661 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sept4P28661 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sept4P28661 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sept4P28661 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sept4P28661 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sept4P28661 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sept4P28661 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sept4P28661 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sept4P28661 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sept4P28661 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sept4P28661 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sept4P28661 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sept4P28661 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sept4P28661 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sept4P28661 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sept4P28661 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sept4P28661 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Sept4P28661 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sept4P28661 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sept4P28661 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sept4P28661 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sept4P28661 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sept4P28661 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sept4P28661 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sept4P28661 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sept4P28661 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sept4P28661 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sept4P28661 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sept4P28661 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sept4P28661 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sept4P28661 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sept4P28661 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sept4P28661 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sept4P28661 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Sept4P28661 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sept4P28661 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sept4P28661 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sept4P28661 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sept4P28661 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sept4P28661 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sept4P28661 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sept4P28661 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sept4P28661 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sept4P28661 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sept4P28661 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sept4P28661 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sept4P28661 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sept4P28661 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sept4P28661 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sept4P28661 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sept4P28661 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sept4P28661 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sept4P28661 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sept4P28661 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sept4P28661 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sept4P28661 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sept4P28661 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sept4P28661 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sept4P28661 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sept4P28661 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sept4P28661 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sept4P28661 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sept4P28661 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sept4P28661 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Sept4P28661 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sept4P28661 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Sept4P28661 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Sept4P28661 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sept4P28661 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sept4P28661 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sept4P28661 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sept4P28661 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms