Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Defa5P28312 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Defa5P28312 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Defa5P28312 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Defa5P28312 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Defa5P28312 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Defa5P28312 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Defa5P28312 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Defa5P28312 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Defa5P28312 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Defa5P28312 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Defa5P28312 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Defa5P28312 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Defa5P28312 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Defa5P28312 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Defa5P28312 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Defa5P28312 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Defa5P28312 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Defa5P28312 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Defa5P28312 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Defa5P28312 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Defa5P28312 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Defa5P28312 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Defa5P28312 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Defa5P28312 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Defa5P28312 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Defa5P28312 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Defa5P28312 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Defa5P28312 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Defa5P28312 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Defa5P28312 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Defa5P28312 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Defa5P28312 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa5P28312 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa5P28312 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Defa5P28312 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa5P28312 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa5P28312 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Defa5P28312 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa5P28312 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa5P28312 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Defa5P28312 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa5P28312 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa5P28312 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Defa5P28312 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Defa5P28312 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Defa5P28312 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Defa5P28312 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Defa5P28312 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Defa5P28312 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Defa5P28312 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Defa5P28312 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Defa5P28312 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Defa5P28312 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Defa5P28312 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Defa5P28312 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Defa5P28312 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Defa5P28312 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Defa5P28312 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Defa5P28312 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa5P28312 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa5P28312 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa5P28312 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa5P28312 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa5P28312 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa5P28312 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa5P28312 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa5P28312 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa5P28312 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa5P28312 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa5P28312 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa5P28312 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa5P28312 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa5P28312 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Defa5P28312 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Defa5P28312 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Defa5P28312 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Defa5P28312 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa5P28312 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa5P28312 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa5P28312 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa5P28312 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa5P28312 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa5P28312 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa5P28312 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa5P28312 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa5P28312 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa5P28312 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa5P28312 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa5P28312 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa5P28312 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa5P28312 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa5P28312 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa5P28312 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa5P28312 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Defa5P28312 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa5P28312 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa5P28312 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa5P28312 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa5P28312 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms