Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
U2af2P26369 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
U2af2P26369 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
U2af2P26369 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
U2af2P26369 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
U2af2P26369 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
U2af2P26369 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
U2af2P26369 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
U2af2P26369 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
U2af2P26369 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
U2af2P26369 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
U2af2P26369 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
U2af2P26369 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
U2af2P26369 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
U2af2P26369 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
U2af2P26369 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
U2af2P26369 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
U2af2P26369 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
U2af2P26369 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
U2af2P26369 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
U2af2P26369 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
U2af2P26369 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
U2af2P26369 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
U2af2P26369 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
U2af2P26369 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
U2af2P26369 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
U2af2P26369 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
U2af2P26369 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
U2af2P26369 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
U2af2P26369 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
U2af2P26369 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
U2af2P26369 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
U2af2P26369 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
U2af2P26369 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
U2af2P26369 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
U2af2P26369 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
U2af2P26369 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
U2af2P26369 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
U2af2P26369 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
U2af2P26369 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
U2af2P26369 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
U2af2P26369 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
U2af2P26369 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
U2af2P26369 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
U2af2P26369 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
U2af2P26369 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
U2af2P26369 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
U2af2P26369 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
U2af2P26369 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
U2af2P26369 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
U2af2P26369 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
U2af2P26369 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
U2af2P26369 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
U2af2P26369 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
U2af2P26369 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
U2af2P26369 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
U2af2P26369 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
U2af2P26369 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
U2af2P26369 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
U2af2P26369 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
U2af2P26369 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
U2af2P26369 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
U2af2P26369 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
U2af2P26369 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
U2af2P26369 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
U2af2P26369 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
U2af2P26369 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
U2af2P26369 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
U2af2P26369 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
U2af2P26369 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
U2af2P26369 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
U2af2P26369 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
U2af2P26369 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
U2af2P26369 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
U2af2P26369 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
U2af2P26369 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
U2af2P26369 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
U2af2P26369 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
U2af2P26369 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
U2af2P26369 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
U2af2P26369 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
U2af2P26369 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
U2af2P26369 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
U2af2P26369 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
U2af2P26369 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
U2af2P26369 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
U2af2P26369 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
U2af2P26369 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
U2af2P26369 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
U2af2P26369 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
U2af2P26369 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
U2af2P26369 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
U2af2P26369 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
U2af2P26369 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
U2af2P26369 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
U2af2P26369 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
U2af2P26369 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
U2af2P26369 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
U2af2P26369 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
U2af2P26369 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms