Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ChgaP26339 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
ChgaP26339 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ChgaP26339 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ChgaP26339 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC31■■■□□ 2.55
ChgaP26339 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
ChgaP26339 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ChgaP26339 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ChgaP26339 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ChgaP26339 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ChgaP26339 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ChgaP26339 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ChgaP26339 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ChgaP26339 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ChgaP26339 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ChgaP26339 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ChgaP26339 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ChgaP26339 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ChgaP26339 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ChgaP26339 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ChgaP26339 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ChgaP26339 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ChgaP26339 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ChgaP26339 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ChgaP26339 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ChgaP26339 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ChgaP26339 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ChgaP26339 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ChgaP26339 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
ChgaP26339 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ChgaP26339 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ChgaP26339 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ChgaP26339 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ChgaP26339 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ChgaP26339 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ChgaP26339 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ChgaP26339 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ChgaP26339 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ChgaP26339 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ChgaP26339 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ChgaP26339 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ChgaP26339 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ChgaP26339 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ChgaP26339 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ChgaP26339 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ChgaP26339 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ChgaP26339 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ChgaP26339 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ChgaP26339 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ChgaP26339 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ChgaP26339 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ChgaP26339 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ChgaP26339 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ChgaP26339 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ChgaP26339 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ChgaP26339 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ChgaP26339 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ChgaP26339 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ChgaP26339 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ChgaP26339 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ChgaP26339 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ChgaP26339 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ChgaP26339 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ChgaP26339 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ChgaP26339 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ChgaP26339 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ChgaP26339 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ChgaP26339 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
ChgaP26339 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ChgaP26339 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ChgaP26339 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ChgaP26339 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ChgaP26339 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ChgaP26339 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ChgaP26339 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ChgaP26339 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ChgaP26339 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ChgaP26339 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ChgaP26339 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ChgaP26339 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ChgaP26339 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ChgaP26339 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ChgaP26339 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ChgaP26339 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ChgaP26339 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
ChgaP26339 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ChgaP26339 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
ChgaP26339 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ChgaP26339 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ChgaP26339 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ChgaP26339 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ChgaP26339 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ChgaP26339 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
ChgaP26339 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ChgaP26339 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ChgaP26339 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ChgaP26339 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ChgaP26339 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ChgaP26339 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ChgaP26339 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms