Protein–RNA interactions for Protein: P21460

Cst3, Cystatin-C, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cst3P21460 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cst3P21460 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cst3P21460 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cst3P21460 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cst3P21460 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cst3P21460 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cst3P21460 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cst3P21460 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cst3P21460 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cst3P21460 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cst3P21460 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cst3P21460 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cst3P21460 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cst3P21460 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cst3P21460 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cst3P21460 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cst3P21460 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cst3P21460 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cst3P21460 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cst3P21460 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cst3P21460 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cst3P21460 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cst3P21460 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cst3P21460 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cst3P21460 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cst3P21460 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cst3P21460 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cst3P21460 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cst3P21460 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cst3P21460 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cst3P21460 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cst3P21460 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cst3P21460 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cst3P21460 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cst3P21460 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cst3P21460 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cst3P21460 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cst3P21460 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cst3P21460 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cst3P21460 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cst3P21460 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cst3P21460 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cst3P21460 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cst3P21460 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cst3P21460 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cst3P21460 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cst3P21460 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cst3P21460 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cst3P21460 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cst3P21460 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cst3P21460 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cst3P21460 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cst3P21460 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cst3P21460 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cst3P21460 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cst3P21460 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cst3P21460 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cst3P21460 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cst3P21460 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cst3P21460 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cst3P21460 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cst3P21460 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cst3P21460 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cst3P21460 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cst3P21460 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cst3P21460 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cst3P21460 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cst3P21460 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cst3P21460 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cst3P21460 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cst3P21460 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cst3P21460 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cst3P21460 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cst3P21460 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cst3P21460 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cst3P21460 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cst3P21460 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cst3P21460 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cst3P21460 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cst3P21460 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cst3P21460 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cst3P21460 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cst3P21460 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cst3P21460 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cst3P21460 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cst3P21460 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cst3P21460 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cst3P21460 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cst3P21460 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cst3P21460 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cst3P21460 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cst3P21460 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cst3P21460 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cst3P21460 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cst3P21460 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cst3P21460 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cst3P21460 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cst3P21460 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cst3P21460 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cst3P21460 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms