Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ntf3P20181 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ntf3P20181 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ntf3P20181 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ntf3P20181 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ntf3P20181 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ntf3P20181 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ntf3P20181 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ntf3P20181 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ntf3P20181 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ntf3P20181 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ntf3P20181 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ntf3P20181 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ntf3P20181 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ntf3P20181 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ntf3P20181 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ntf3P20181 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ntf3P20181 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ntf3P20181 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ntf3P20181 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ntf3P20181 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ntf3P20181 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ntf3P20181 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ntf3P20181 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ntf3P20181 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ntf3P20181 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ntf3P20181 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ntf3P20181 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ntf3P20181 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ntf3P20181 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ntf3P20181 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ntf3P20181 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ntf3P20181 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ntf3P20181 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ntf3P20181 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ntf3P20181 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ntf3P20181 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ntf3P20181 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ntf3P20181 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ntf3P20181 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ntf3P20181 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ntf3P20181 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ntf3P20181 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ntf3P20181 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ntf3P20181 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ntf3P20181 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ntf3P20181 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ntf3P20181 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ntf3P20181 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ntf3P20181 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ntf3P20181 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ntf3P20181 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ntf3P20181 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ntf3P20181 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ntf3P20181 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ntf3P20181 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ntf3P20181 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ntf3P20181 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ntf3P20181 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ntf3P20181 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ntf3P20181 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ntf3P20181 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ntf3P20181 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ntf3P20181 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ntf3P20181 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ntf3P20181 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ntf3P20181 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ntf3P20181 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ntf3P20181 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ntf3P20181 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ntf3P20181 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ntf3P20181 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ntf3P20181 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ntf3P20181 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ntf3P20181 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ntf3P20181 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ntf3P20181 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ntf3P20181 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ntf3P20181 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ntf3P20181 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ntf3P20181 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ntf3P20181 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ntf3P20181 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ntf3P20181 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ntf3P20181 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ntf3P20181 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ntf3P20181 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ntf3P20181 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ntf3P20181 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ntf3P20181 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ntf3P20181 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ntf3P20181 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ntf3P20181 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ntf3P20181 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ntf3P20181 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ntf3P20181 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ntf3P20181 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ntf3P20181 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ntf3P20181 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ntf3P20181 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms