Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PdgfaP20033 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PdgfaP20033 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PdgfaP20033 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PdgfaP20033 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PdgfaP20033 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PdgfaP20033 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PdgfaP20033 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PdgfaP20033 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PdgfaP20033 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PdgfaP20033 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PdgfaP20033 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PdgfaP20033 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PdgfaP20033 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PdgfaP20033 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PdgfaP20033 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PdgfaP20033 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PdgfaP20033 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PdgfaP20033 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PdgfaP20033 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PdgfaP20033 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PdgfaP20033 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PdgfaP20033 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PdgfaP20033 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PdgfaP20033 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PdgfaP20033 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PdgfaP20033 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PdgfaP20033 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PdgfaP20033 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PdgfaP20033 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PdgfaP20033 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PdgfaP20033 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PdgfaP20033 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PdgfaP20033 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PdgfaP20033 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PdgfaP20033 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PdgfaP20033 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PdgfaP20033 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PdgfaP20033 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PdgfaP20033 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PdgfaP20033 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PdgfaP20033 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PdgfaP20033 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PdgfaP20033 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PdgfaP20033 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PdgfaP20033 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PdgfaP20033 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PdgfaP20033 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PdgfaP20033 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PdgfaP20033 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PdgfaP20033 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PdgfaP20033 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PdgfaP20033 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PdgfaP20033 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PdgfaP20033 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PdgfaP20033 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PdgfaP20033 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PdgfaP20033 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PdgfaP20033 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PdgfaP20033 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PdgfaP20033 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PdgfaP20033 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PdgfaP20033 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PdgfaP20033 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PdgfaP20033 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PdgfaP20033 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PdgfaP20033 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PdgfaP20033 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PdgfaP20033 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PdgfaP20033 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PdgfaP20033 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PdgfaP20033 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PdgfaP20033 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PdgfaP20033 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PdgfaP20033 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PdgfaP20033 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PdgfaP20033 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PdgfaP20033 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PdgfaP20033 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PdgfaP20033 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PdgfaP20033 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PdgfaP20033 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PdgfaP20033 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PdgfaP20033 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PdgfaP20033 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PdgfaP20033 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PdgfaP20033 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PdgfaP20033 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PdgfaP20033 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PdgfaP20033 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PdgfaP20033 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PdgfaP20033 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PdgfaP20033 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PdgfaP20033 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PdgfaP20033 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PdgfaP20033 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PdgfaP20033 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PdgfaP20033 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PdgfaP20033 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PdgfaP20033 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.9 ms