Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim30aP15533 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim30aP15533 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim30aP15533 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim30aP15533 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim30aP15533 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim30aP15533 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim30aP15533 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trim30aP15533 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trim30aP15533 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim30aP15533 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim30aP15533 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim30aP15533 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim30aP15533 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim30aP15533 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim30aP15533 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim30aP15533 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim30aP15533 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim30aP15533 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim30aP15533 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Trim30aP15533 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Trim30aP15533 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim30aP15533 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim30aP15533 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Trim30aP15533 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim30aP15533 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim30aP15533 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim30aP15533 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim30aP15533 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim30aP15533 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim30aP15533 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Trim30aP15533 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim30aP15533 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim30aP15533 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim30aP15533 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim30aP15533 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim30aP15533 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim30aP15533 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim30aP15533 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim30aP15533 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim30aP15533 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trim30aP15533 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Trim30aP15533 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim30aP15533 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim30aP15533 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim30aP15533 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim30aP15533 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim30aP15533 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim30aP15533 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim30aP15533 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trim30aP15533 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim30aP15533 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim30aP15533 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim30aP15533 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim30aP15533 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim30aP15533 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim30aP15533 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim30aP15533 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim30aP15533 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim30aP15533 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim30aP15533 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim30aP15533 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim30aP15533 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim30aP15533 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim30aP15533 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim30aP15533 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim30aP15533 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim30aP15533 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim30aP15533 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim30aP15533 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim30aP15533 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim30aP15533 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim30aP15533 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim30aP15533 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim30aP15533 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trim30aP15533 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim30aP15533 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim30aP15533 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim30aP15533 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim30aP15533 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim30aP15533 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim30aP15533 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim30aP15533 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim30aP15533 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim30aP15533 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim30aP15533 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim30aP15533 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim30aP15533 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim30aP15533 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim30aP15533 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim30aP15533 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim30aP15533 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim30aP15533 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim30aP15533 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim30aP15533 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim30aP15533 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim30aP15533 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim30aP15533 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Trim30aP15533 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim30aP15533 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms