Protein–RNA interactions for Protein: P14211

Calr, Calreticulin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalrP14211 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CalrP14211 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CalrP14211 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CalrP14211 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CalrP14211 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CalrP14211 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CalrP14211 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CalrP14211 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CalrP14211 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CalrP14211 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CalrP14211 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CalrP14211 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CalrP14211 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CalrP14211 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CalrP14211 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CalrP14211 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CalrP14211 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CalrP14211 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CalrP14211 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CalrP14211 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CalrP14211 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CalrP14211 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CalrP14211 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CalrP14211 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CalrP14211 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CalrP14211 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CalrP14211 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CalrP14211 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CalrP14211 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CalrP14211 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CalrP14211 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CalrP14211 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CalrP14211 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CalrP14211 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CalrP14211 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CalrP14211 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CalrP14211 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CalrP14211 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CalrP14211 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CalrP14211 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CalrP14211 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CalrP14211 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CalrP14211 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CalrP14211 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CalrP14211 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CalrP14211 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CalrP14211 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CalrP14211 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CalrP14211 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CalrP14211 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CalrP14211 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CalrP14211 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CalrP14211 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CalrP14211 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CalrP14211 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CalrP14211 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CalrP14211 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CalrP14211 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CalrP14211 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CalrP14211 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CalrP14211 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CalrP14211 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CalrP14211 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CalrP14211 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CalrP14211 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CalrP14211 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CalrP14211 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CalrP14211 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CalrP14211 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CalrP14211 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CalrP14211 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CalrP14211 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CalrP14211 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CalrP14211 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CalrP14211 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CalrP14211 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CalrP14211 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CalrP14211 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CalrP14211 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CalrP14211 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CalrP14211 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CalrP14211 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CalrP14211 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CalrP14211 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CalrP14211 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CalrP14211 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CalrP14211 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CalrP14211 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CalrP14211 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CalrP14211 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CalrP14211 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CalrP14211 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CalrP14211 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CalrP14211 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CalrP14211 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CalrP14211 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CalrP14211 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CalrP14211 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CalrP14211 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CalrP14211 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms