Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga5P11688 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga5P11688 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga5P11688 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga5P11688 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga5P11688 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga5P11688 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga5P11688 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga5P11688 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga5P11688 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga5P11688 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga5P11688 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga5P11688 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga5P11688 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga5P11688 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga5P11688 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga5P11688 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga5P11688 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga5P11688 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga5P11688 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga5P11688 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga5P11688 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itga5P11688 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Itga5P11688 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga5P11688 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga5P11688 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga5P11688 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga5P11688 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga5P11688 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga5P11688 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga5P11688 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga5P11688 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga5P11688 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga5P11688 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itga5P11688 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga5P11688 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga5P11688 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga5P11688 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga5P11688 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga5P11688 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga5P11688 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga5P11688 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga5P11688 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga5P11688 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga5P11688 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga5P11688 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga5P11688 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga5P11688 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga5P11688 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itga5P11688 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itga5P11688 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itga5P11688 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itga5P11688 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itga5P11688 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga5P11688 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga5P11688 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga5P11688 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga5P11688 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga5P11688 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga5P11688 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga5P11688 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga5P11688 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga5P11688 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga5P11688 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga5P11688 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga5P11688 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga5P11688 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga5P11688 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga5P11688 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga5P11688 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga5P11688 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga5P11688 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga5P11688 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga5P11688 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga5P11688 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga5P11688 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga5P11688 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga5P11688 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga5P11688 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga5P11688 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga5P11688 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga5P11688 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga5P11688 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga5P11688 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga5P11688 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga5P11688 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga5P11688 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga5P11688 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga5P11688 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga5P11688 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga5P11688 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga5P11688 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga5P11688 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga5P11688 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itga5P11688 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga5P11688 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga5P11688 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga5P11688 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga5P11688 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga5P11688 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms