Protein–RNA interactions for Protein: P11103

Parp1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp1P11103 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Parp1P11103 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Parp1P11103 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Parp1P11103 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Parp1P11103 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Parp1P11103 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Parp1P11103 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Parp1P11103 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Parp1P11103 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Parp1P11103 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Parp1P11103 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Parp1P11103 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Parp1P11103 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Parp1P11103 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Parp1P11103 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Parp1P11103 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Parp1P11103 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Parp1P11103 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Parp1P11103 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Parp1P11103 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Parp1P11103 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Parp1P11103 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Parp1P11103 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Parp1P11103 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Parp1P11103 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Parp1P11103 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Parp1P11103 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Parp1P11103 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Parp1P11103 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Parp1P11103 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Parp1P11103 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Parp1P11103 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Parp1P11103 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Parp1P11103 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Parp1P11103 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Parp1P11103 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Parp1P11103 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Parp1P11103 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Parp1P11103 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Parp1P11103 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Parp1P11103 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Parp1P11103 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Parp1P11103 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Parp1P11103 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Parp1P11103 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Parp1P11103 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Parp1P11103 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Parp1P11103 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Parp1P11103 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Parp1P11103 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Parp1P11103 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Parp1P11103 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Parp1P11103 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Parp1P11103 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Parp1P11103 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Parp1P11103 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Parp1P11103 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Parp1P11103 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Parp1P11103 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Parp1P11103 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Parp1P11103 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Parp1P11103 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Parp1P11103 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Parp1P11103 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Parp1P11103 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Parp1P11103 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Parp1P11103 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Parp1P11103 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Parp1P11103 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Parp1P11103 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Parp1P11103 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Parp1P11103 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Parp1P11103 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Parp1P11103 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Parp1P11103 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Parp1P11103 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Parp1P11103 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Parp1P11103 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Parp1P11103 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Parp1P11103 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Parp1P11103 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Parp1P11103 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Parp1P11103 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Parp1P11103 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Parp1P11103 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Parp1P11103 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Parp1P11103 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Parp1P11103 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Parp1P11103 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Parp1P11103 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Parp1P11103 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Parp1P11103 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Parp1P11103 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Parp1P11103 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Parp1P11103 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Parp1P11103 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Parp1P11103 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Parp1P11103 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Parp1P11103 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Parp1P11103 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms