Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Schip1P0DPB4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Schip1P0DPB4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Schip1P0DPB4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Schip1P0DPB4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Schip1P0DPB4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Schip1P0DPB4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Schip1P0DPB4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Schip1P0DPB4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Schip1P0DPB4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Schip1P0DPB4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Schip1P0DPB4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Schip1P0DPB4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Schip1P0DPB4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Schip1P0DPB4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Schip1P0DPB4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Schip1P0DPB4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Schip1P0DPB4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Schip1P0DPB4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Schip1P0DPB4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Schip1P0DPB4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Schip1P0DPB4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Schip1P0DPB4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Schip1P0DPB4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Schip1P0DPB4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Schip1P0DPB4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Schip1P0DPB4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Schip1P0DPB4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Schip1P0DPB4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Schip1P0DPB4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Schip1P0DPB4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Schip1P0DPB4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Schip1P0DPB4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Schip1P0DPB4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Schip1P0DPB4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Schip1P0DPB4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Schip1P0DPB4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Schip1P0DPB4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Schip1P0DPB4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Schip1P0DPB4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Schip1P0DPB4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Schip1P0DPB4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Schip1P0DPB4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Schip1P0DPB4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Schip1P0DPB4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Schip1P0DPB4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Schip1P0DPB4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Schip1P0DPB4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Schip1P0DPB4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Schip1P0DPB4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Schip1P0DPB4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Schip1P0DPB4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Schip1P0DPB4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Schip1P0DPB4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Schip1P0DPB4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Schip1P0DPB4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Schip1P0DPB4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Schip1P0DPB4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Schip1P0DPB4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Schip1P0DPB4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Schip1P0DPB4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Schip1P0DPB4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Schip1P0DPB4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Schip1P0DPB4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Schip1P0DPB4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Schip1P0DPB4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Schip1P0DPB4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Schip1P0DPB4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Schip1P0DPB4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Schip1P0DPB4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Schip1P0DPB4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Schip1P0DPB4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Schip1P0DPB4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Schip1P0DPB4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Schip1P0DPB4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Schip1P0DPB4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Schip1P0DPB4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Schip1P0DPB4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Schip1P0DPB4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Schip1P0DPB4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Schip1P0DPB4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Schip1P0DPB4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Schip1P0DPB4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Schip1P0DPB4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Schip1P0DPB4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Schip1P0DPB4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Schip1P0DPB4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Schip1P0DPB4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Schip1P0DPB4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Schip1P0DPB4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Schip1P0DPB4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Schip1P0DPB4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Schip1P0DPB4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Schip1P0DPB4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Schip1P0DPB4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Schip1P0DPB4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Schip1P0DPB4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Schip1P0DPB4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Schip1P0DPB4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Schip1P0DPB4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms