Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem254bP0DN90 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem254bP0DN90 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem254bP0DN90 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem254bP0DN90 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem254bP0DN90 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem254bP0DN90 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem254bP0DN90 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem254bP0DN90 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem254bP0DN90 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem254bP0DN90 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem254bP0DN90 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem254bP0DN90 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem254bP0DN90 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem254bP0DN90 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem254bP0DN90 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem254bP0DN90 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem254bP0DN90 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem254bP0DN90 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem254bP0DN90 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem254bP0DN90 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem254bP0DN90 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem254bP0DN90 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem254bP0DN90 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem254bP0DN90 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem254bP0DN90 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem254bP0DN90 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem254bP0DN90 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem254bP0DN90 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem254bP0DN90 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem254bP0DN90 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem254bP0DN90 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem254bP0DN90 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem254bP0DN90 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem254bP0DN90 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem254bP0DN90 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem254bP0DN90 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Tmem254bP0DN90 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem254bP0DN90 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem254bP0DN90 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem254bP0DN90 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem254bP0DN90 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem254bP0DN90 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem254bP0DN90 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem254bP0DN90 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem254bP0DN90 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem254bP0DN90 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem254bP0DN90 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem254bP0DN90 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem254bP0DN90 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem254bP0DN90 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem254bP0DN90 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem254bP0DN90 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem254bP0DN90 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem254bP0DN90 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem254bP0DN90 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem254bP0DN90 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem254bP0DN90 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem254bP0DN90 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem254bP0DN90 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem254bP0DN90 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem254bP0DN90 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem254bP0DN90 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem254bP0DN90 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem254bP0DN90 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem254bP0DN90 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem254bP0DN90 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem254bP0DN90 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem254bP0DN90 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem254bP0DN90 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem254bP0DN90 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem254bP0DN90 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem254bP0DN90 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem254bP0DN90 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem254bP0DN90 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem254bP0DN90 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem254bP0DN90 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem254bP0DN90 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem254bP0DN90 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem254bP0DN90 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem254bP0DN90 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem254bP0DN90 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem254bP0DN90 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem254bP0DN90 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem254bP0DN90 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem254bP0DN90 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem254bP0DN90 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem254bP0DN90 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem254bP0DN90 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem254bP0DN90 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem254bP0DN90 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem254bP0DN90 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem254bP0DN90 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem254bP0DN90 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem254bP0DN90 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem254bP0DN90 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem254bP0DN90 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem254bP0DN90 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem254bP0DN90 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem254bP0DN90 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 6.7 ms