Protein–RNA interactions for Protein: P07978

Prm2, Protamine-2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm2P07978 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prm2P07978 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prm2P07978 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prm2P07978 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prm2P07978 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prm2P07978 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prm2P07978 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prm2P07978 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prm2P07978 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prm2P07978 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prm2P07978 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prm2P07978 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prm2P07978 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prm2P07978 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prm2P07978 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prm2P07978 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prm2P07978 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prm2P07978 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prm2P07978 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prm2P07978 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prm2P07978 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prm2P07978 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prm2P07978 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prm2P07978 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prm2P07978 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prm2P07978 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prm2P07978 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Prm2P07978 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prm2P07978 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prm2P07978 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prm2P07978 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prm2P07978 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prm2P07978 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prm2P07978 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prm2P07978 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prm2P07978 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prm2P07978 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prm2P07978 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prm2P07978 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prm2P07978 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prm2P07978 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prm2P07978 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prm2P07978 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prm2P07978 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prm2P07978 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prm2P07978 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prm2P07978 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prm2P07978 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prm2P07978 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prm2P07978 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prm2P07978 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prm2P07978 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prm2P07978 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prm2P07978 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prm2P07978 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prm2P07978 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prm2P07978 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prm2P07978 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prm2P07978 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prm2P07978 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prm2P07978 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Prm2P07978 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prm2P07978 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prm2P07978 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prm2P07978 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prm2P07978 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prm2P07978 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prm2P07978 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prm2P07978 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prm2P07978 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prm2P07978 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prm2P07978 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prm2P07978 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Prm2P07978 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Prm2P07978 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prm2P07978 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prm2P07978 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prm2P07978 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prm2P07978 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prm2P07978 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prm2P07978 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prm2P07978 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prm2P07978 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prm2P07978 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prm2P07978 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prm2P07978 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prm2P07978 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prm2P07978 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Prm2P07978 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prm2P07978 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prm2P07978 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Prm2P07978 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prm2P07978 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prm2P07978 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prm2P07978 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prm2P07978 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prm2P07978 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prm2P07978 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prm2P07978 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prm2P07978 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms