Protein–RNA interactions for Protein: P07744

Krt4, Keratin, type II cytoskeletal 4, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt4P07744 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt4P07744 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt4P07744 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt4P07744 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt4P07744 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt4P07744 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt4P07744 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt4P07744 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt4P07744 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt4P07744 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt4P07744 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt4P07744 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt4P07744 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Krt4P07744 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt4P07744 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt4P07744 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt4P07744 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt4P07744 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt4P07744 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt4P07744 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt4P07744 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt4P07744 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt4P07744 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Krt4P07744 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt4P07744 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt4P07744 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt4P07744 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt4P07744 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt4P07744 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt4P07744 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt4P07744 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt4P07744 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt4P07744 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt4P07744 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt4P07744 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt4P07744 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt4P07744 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt4P07744 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt4P07744 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt4P07744 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt4P07744 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt4P07744 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt4P07744 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt4P07744 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt4P07744 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt4P07744 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt4P07744 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt4P07744 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt4P07744 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt4P07744 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt4P07744 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt4P07744 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt4P07744 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt4P07744 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt4P07744 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt4P07744 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt4P07744 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt4P07744 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt4P07744 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt4P07744 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt4P07744 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Krt4P07744 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Krt4P07744 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt4P07744 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt4P07744 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt4P07744 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt4P07744 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt4P07744 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt4P07744 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt4P07744 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt4P07744 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt4P07744 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt4P07744 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt4P07744 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt4P07744 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt4P07744 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Krt4P07744 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt4P07744 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt4P07744 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt4P07744 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt4P07744 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt4P07744 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt4P07744 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt4P07744 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt4P07744 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt4P07744 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt4P07744 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt4P07744 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt4P07744 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt4P07744 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt4P07744 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt4P07744 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt4P07744 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt4P07744 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt4P07744 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt4P07744 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt4P07744 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt4P07744 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt4P07744 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt4P07744 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms