Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csf1P07141 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csf1P07141 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csf1P07141 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csf1P07141 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csf1P07141 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csf1P07141 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csf1P07141 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csf1P07141 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csf1P07141 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csf1P07141 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csf1P07141 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Csf1P07141 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Csf1P07141 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Csf1P07141 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Csf1P07141 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csf1P07141 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csf1P07141 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csf1P07141 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csf1P07141 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csf1P07141 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csf1P07141 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csf1P07141 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csf1P07141 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csf1P07141 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csf1P07141 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Csf1P07141 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Csf1P07141 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Csf1P07141 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Csf1P07141 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Csf1P07141 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Csf1P07141 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Csf1P07141 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Csf1P07141 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Csf1P07141 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Csf1P07141 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Csf1P07141 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Csf1P07141 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Csf1P07141 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Csf1P07141 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Csf1P07141 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Csf1P07141 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Csf1P07141 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Csf1P07141 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Csf1P07141 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Csf1P07141 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Csf1P07141 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csf1P07141 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csf1P07141 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csf1P07141 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csf1P07141 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csf1P07141 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Csf1P07141 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Csf1P07141 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Csf1P07141 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Csf1P07141 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Csf1P07141 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Csf1P07141 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Csf1P07141 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Csf1P07141 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Csf1P07141 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Csf1P07141 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Csf1P07141 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Csf1P07141 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Csf1P07141 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Csf1P07141 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Csf1P07141 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Csf1P07141 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Csf1P07141 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Csf1P07141 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Csf1P07141 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csf1P07141 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csf1P07141 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csf1P07141 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Csf1P07141 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csf1P07141 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csf1P07141 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csf1P07141 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csf1P07141 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csf1P07141 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csf1P07141 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Csf1P07141 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Csf1P07141 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Csf1P07141 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Csf1P07141 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Csf1P07141 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Csf1P07141 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csf1P07141 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csf1P07141 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csf1P07141 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Csf1P07141 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Csf1P07141 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Csf1P07141 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Csf1P07141 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Csf1P07141 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csf1P07141 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csf1P07141 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csf1P07141 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Csf1P07141 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Csf1P07141 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms