Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tgfb1P04202 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tgfb1P04202 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tgfb1P04202 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tgfb1P04202 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tgfb1P04202 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tgfb1P04202 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tgfb1P04202 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tgfb1P04202 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tgfb1P04202 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tgfb1P04202 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tgfb1P04202 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tgfb1P04202 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tgfb1P04202 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tgfb1P04202 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tgfb1P04202 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tgfb1P04202 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tgfb1P04202 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tgfb1P04202 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgfb1P04202 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tgfb1P04202 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tgfb1P04202 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tgfb1P04202 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tgfb1P04202 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tgfb1P04202 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tgfb1P04202 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgfb1P04202 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgfb1P04202 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgfb1P04202 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgfb1P04202 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgfb1P04202 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tgfb1P04202 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tgfb1P04202 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tgfb1P04202 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tgfb1P04202 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tgfb1P04202 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgfb1P04202 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgfb1P04202 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tgfb1P04202 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tgfb1P04202 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tgfb1P04202 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgfb1P04202 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgfb1P04202 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgfb1P04202 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tgfb1P04202 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tgfb1P04202 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tgfb1P04202 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tgfb1P04202 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tgfb1P04202 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tgfb1P04202 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tgfb1P04202 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tgfb1P04202 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tgfb1P04202 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tgfb1P04202 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tgfb1P04202 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tgfb1P04202 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgfb1P04202 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgfb1P04202 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgfb1P04202 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgfb1P04202 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgfb1P04202 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgfb1P04202 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgfb1P04202 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tgfb1P04202 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgfb1P04202 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgfb1P04202 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgfb1P04202 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tgfb1P04202 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tgfb1P04202 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tgfb1P04202 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tgfb1P04202 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tgfb1P04202 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tgfb1P04202 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tgfb1P04202 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tgfb1P04202 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tgfb1P04202 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tgfb1P04202 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tgfb1P04202 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tgfb1P04202 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tgfb1P04202 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tgfb1P04202 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tgfb1P04202 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tgfb1P04202 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tgfb1P04202 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tgfb1P04202 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tgfb1P04202 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tgfb1P04202 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tgfb1P04202 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tgfb1P04202 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tgfb1P04202 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tgfb1P04202 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tgfb1P04202 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgfb1P04202 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tgfb1P04202 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tgfb1P04202 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tgfb1P04202 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tgfb1P04202 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tgfb1P04202 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tgfb1P04202 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tgfb1P04202 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms