Protein–RNA interactions for Protein: P01869

Ighg1, Ig gamma-1 chain C region, membrane-bound form, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighg1P01869 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ighg1P01869 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ighg1P01869 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ighg1P01869 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ighg1P01869 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ighg1P01869 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ighg1P01869 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ighg1P01869 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ighg1P01869 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ighg1P01869 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ighg1P01869 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ighg1P01869 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ighg1P01869 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ighg1P01869 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ighg1P01869 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ighg1P01869 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ighg1P01869 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ighg1P01869 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ighg1P01869 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ighg1P01869 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ighg1P01869 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ighg1P01869 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ighg1P01869 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ighg1P01869 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ighg1P01869 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ighg1P01869 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ighg1P01869 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ighg1P01869 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ighg1P01869 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ighg1P01869 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ighg1P01869 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ighg1P01869 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ighg1P01869 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ighg1P01869 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ighg1P01869 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ighg1P01869 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ighg1P01869 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ighg1P01869 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ighg1P01869 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ighg1P01869 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ighg1P01869 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ighg1P01869 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ighg1P01869 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ighg1P01869 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ighg1P01869 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ighg1P01869 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ighg1P01869 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ighg1P01869 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ighg1P01869 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ighg1P01869 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ighg1P01869 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ighg1P01869 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ighg1P01869 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ighg1P01869 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ighg1P01869 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ighg1P01869 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ighg1P01869 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ighg1P01869 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ighg1P01869 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ighg1P01869 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ighg1P01869 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ighg1P01869 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ighg1P01869 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ighg1P01869 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ighg1P01869 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ighg1P01869 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ighg1P01869 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ighg1P01869 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ighg1P01869 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ighg1P01869 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ighg1P01869 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ighg1P01869 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ighg1P01869 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ighg1P01869 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ighg1P01869 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ighg1P01869 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ighg1P01869 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ighg1P01869 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ighg1P01869 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ighg1P01869 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ighg1P01869 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ighg1P01869 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ighg1P01869 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ighg1P01869 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ighg1P01869 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ighg1P01869 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ighg1P01869 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ighg1P01869 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ighg1P01869 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ighg1P01869 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ighg1P01869 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ighg1P01869 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ighg1P01869 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ighg1P01869 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ighg1P01869 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ighg1P01869 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ighg1P01869 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ighg1P01869 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ighg1P01869 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ighg1P01869 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms