Protein–RNA interactions for Protein: P01851

T-cell receptor beta-2 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01851 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01851 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
P01851 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
P01851 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01851 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01851 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01851 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01851 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01851 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01851 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01851 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01851 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01851 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01851 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
P01851 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01851 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01851 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01851 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01851 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01851 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01851 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01851 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01851 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01851 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01851 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01851 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
P01851 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
P01851 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01851 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
P01851 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
P01851 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
P01851 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
P01851 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
P01851 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01851 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01851 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01851 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01851 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01851 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01851 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01851 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01851 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01851 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01851 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
P01851 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
P01851 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P01851 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01851 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01851 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
P01851 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01851 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01851 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01851 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
P01851 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
P01851 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01851 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01851 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01851 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01851 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
P01851 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
P01851 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
P01851 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01851 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01851 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01851 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01851 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
P01851 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01851 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01851 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01851 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01851 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01851 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01851 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01851 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01851 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01851 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01851 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01851 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01851 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01851 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01851 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01851 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01851 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01851 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01851 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01851 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
P01851 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P01851 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P01851 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01851 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01851 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01851 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01851 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01851 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
P01851 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01851 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01851 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
P01851 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
P01851 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
P01851 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms