Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
P01735 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01735 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01735 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
P01735 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P01735 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01735 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01735 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01735 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01735 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01735 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01735 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01735 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
P01735 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
P01735 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
P01735 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01735 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01735 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P01735 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
P01735 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01735 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
P01735 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
P01735 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
P01735 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01735 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01735 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01735 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01735 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01735 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01735 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01735 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01735 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01735 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01735 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
P01735 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01735 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01735 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01735 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01735 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01735 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01735 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01735 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01735 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01735 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
P01735 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01735 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01735 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01735 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01735 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01735 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01735 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
P01735 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
P01735 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01735 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01735 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01735 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01735 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01735 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01735 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01735 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01735 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P01735 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01735 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01735 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01735 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01735 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01735 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01735 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01735 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01735 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01735 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01735 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01735 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01735 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01735 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01735 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01735 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01735 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P01735 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23■■□□□ 1.27
P01735 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
P01735 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01735 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01735 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
P01735 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01735 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01735 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01735 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01735 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01735 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01735 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01735 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01735 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01735 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01735 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01735 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01735 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01735 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
P01735 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01735 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01735 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms